Protein–RNA interactions for Protein: P55809

OXCT1, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXCT1P55809 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
OXCT1P55809 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
OXCT1P55809 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
OXCT1P55809 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
OXCT1P55809 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
OXCT1P55809 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
OXCT1P55809 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
OXCT1P55809 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
OXCT1P55809 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
OXCT1P55809 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
OXCT1P55809 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
OXCT1P55809 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
OXCT1P55809 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
OXCT1P55809 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
OXCT1P55809 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
OXCT1P55809 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
OXCT1P55809 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
OXCT1P55809 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
OXCT1P55809 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
OXCT1P55809 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
OXCT1P55809 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
OXCT1P55809 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
OXCT1P55809 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
OXCT1P55809 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
OXCT1P55809 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
OXCT1P55809 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
OXCT1P55809 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
OXCT1P55809 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
OXCT1P55809 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
OXCT1P55809 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
OXCT1P55809 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
OXCT1P55809 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
OXCT1P55809 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
OXCT1P55809 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
OXCT1P55809 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
OXCT1P55809 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
OXCT1P55809 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
OXCT1P55809 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
OXCT1P55809 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
OXCT1P55809 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
OXCT1P55809 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
OXCT1P55809 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
OXCT1P55809 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
OXCT1P55809 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
OXCT1P55809 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25■■□□□ 1.59
OXCT1P55809 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
OXCT1P55809 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
OXCT1P55809 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
OXCT1P55809 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
OXCT1P55809 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
OXCT1P55809 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
OXCT1P55809 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
OXCT1P55809 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
OXCT1P55809 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
OXCT1P55809 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
OXCT1P55809 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
OXCT1P55809 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
OXCT1P55809 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
OXCT1P55809 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
OXCT1P55809 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
OXCT1P55809 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
OXCT1P55809 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
OXCT1P55809 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
OXCT1P55809 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
OXCT1P55809 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
OXCT1P55809 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
OXCT1P55809 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
OXCT1P55809 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
OXCT1P55809 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
OXCT1P55809 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
OXCT1P55809 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
OXCT1P55809 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
OXCT1P55809 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
OXCT1P55809 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
OXCT1P55809 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
OXCT1P55809 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
OXCT1P55809 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
OXCT1P55809 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
OXCT1P55809 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
OXCT1P55809 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
OXCT1P55809 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
OXCT1P55809 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
OXCT1P55809 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
OXCT1P55809 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
OXCT1P55809 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
OXCT1P55809 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
OXCT1P55809 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
OXCT1P55809 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
OXCT1P55809 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
OXCT1P55809 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
OXCT1P55809 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
OXCT1P55809 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
OXCT1P55809 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
OXCT1P55809 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
OXCT1P55809 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
OXCT1P55809 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
OXCT1P55809 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
OXCT1P55809 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
OXCT1P55809 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
OXCT1P55809 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms