Protein–RNA interactions for Protein: P55107

GDF10, Growth/differentiation factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF10P55107 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GDF10P55107 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GDF10P55107 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GDF10P55107 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GDF10P55107 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GDF10P55107 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GDF10P55107 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GDF10P55107 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GDF10P55107 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GDF10P55107 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GDF10P55107 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GDF10P55107 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GDF10P55107 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GDF10P55107 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GDF10P55107 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GDF10P55107 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GDF10P55107 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GDF10P55107 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GDF10P55107 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GDF10P55107 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GDF10P55107 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GDF10P55107 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GDF10P55107 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GDF10P55107 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GDF10P55107 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GDF10P55107 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GDF10P55107 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GDF10P55107 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GDF10P55107 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GDF10P55107 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GDF10P55107 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GDF10P55107 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GDF10P55107 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GDF10P55107 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GDF10P55107 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GDF10P55107 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDF10P55107 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDF10P55107 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDF10P55107 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GDF10P55107 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GDF10P55107 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GDF10P55107 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GDF10P55107 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GDF10P55107 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GDF10P55107 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
GDF10P55107 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GDF10P55107 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GDF10P55107 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GDF10P55107 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GDF10P55107 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GDF10P55107 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GDF10P55107 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GDF10P55107 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GDF10P55107 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GDF10P55107 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GDF10P55107 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GDF10P55107 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GDF10P55107 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GDF10P55107 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GDF10P55107 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GDF10P55107 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GDF10P55107 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GDF10P55107 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GDF10P55107 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GDF10P55107 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GDF10P55107 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GDF10P55107 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GDF10P55107 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GDF10P55107 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GDF10P55107 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GDF10P55107 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GDF10P55107 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GDF10P55107 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GDF10P55107 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GDF10P55107 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GDF10P55107 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GDF10P55107 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GDF10P55107 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GDF10P55107 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GDF10P55107 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GDF10P55107 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GDF10P55107 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GDF10P55107 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GDF10P55107 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GDF10P55107 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GDF10P55107 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GDF10P55107 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GDF10P55107 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GDF10P55107 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GDF10P55107 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GDF10P55107 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GDF10P55107 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GDF10P55107 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GDF10P55107 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GDF10P55107 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GDF10P55107 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GDF10P55107 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GDF10P55107 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GDF10P55107 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GDF10P55107 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 183.8 ms