Protein–RNA interactions for Protein: P55040

GEM, GTP-binding protein GEM, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMP55040 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GEMP55040 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GEMP55040 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GEMP55040 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GEMP55040 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GEMP55040 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GEMP55040 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GEMP55040 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GEMP55040 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GEMP55040 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GEMP55040 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GEMP55040 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GEMP55040 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GEMP55040 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GEMP55040 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GEMP55040 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GEMP55040 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GEMP55040 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GEMP55040 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GEMP55040 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GEMP55040 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GEMP55040 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GEMP55040 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GEMP55040 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GEMP55040 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GEMP55040 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GEMP55040 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GEMP55040 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GEMP55040 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GEMP55040 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GEMP55040 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GEMP55040 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GEMP55040 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GEMP55040 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GEMP55040 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GEMP55040 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GEMP55040 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GEMP55040 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GEMP55040 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GEMP55040 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GEMP55040 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GEMP55040 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GEMP55040 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GEMP55040 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GEMP55040 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GEMP55040 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GEMP55040 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GEMP55040 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GEMP55040 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GEMP55040 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GEMP55040 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GEMP55040 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GEMP55040 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GEMP55040 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GEMP55040 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GEMP55040 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GEMP55040 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GEMP55040 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GEMP55040 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GEMP55040 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GEMP55040 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GEMP55040 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GEMP55040 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GEMP55040 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GEMP55040 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GEMP55040 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GEMP55040 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GEMP55040 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GEMP55040 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GEMP55040 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GEMP55040 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GEMP55040 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GEMP55040 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GEMP55040 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GEMP55040 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GEMP55040 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GEMP55040 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GEMP55040 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GEMP55040 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GEMP55040 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GEMP55040 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GEMP55040 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GEMP55040 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GEMP55040 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GEMP55040 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GEMP55040 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GEMP55040 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GEMP55040 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GEMP55040 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GEMP55040 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GEMP55040 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GEMP55040 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GEMP55040 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GEMP55040 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GEMP55040 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GEMP55040 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GEMP55040 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GEMP55040 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GEMP55040 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GEMP55040 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms