Protein–RNA interactions for Protein: P54577

YARS, Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YARSP54577 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
YARSP54577 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
YARSP54577 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
YARSP54577 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
YARSP54577 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
YARSP54577 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
YARSP54577 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
YARSP54577 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
YARSP54577 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
YARSP54577 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
YARSP54577 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
YARSP54577 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
YARSP54577 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
YARSP54577 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
YARSP54577 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
YARSP54577 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
YARSP54577 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
YARSP54577 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
YARSP54577 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
YARSP54577 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
YARSP54577 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
YARSP54577 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
YARSP54577 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
YARSP54577 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
YARSP54577 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
YARSP54577 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
YARSP54577 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
YARSP54577 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
YARSP54577 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
YARSP54577 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
YARSP54577 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
YARSP54577 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
YARSP54577 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
YARSP54577 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
YARSP54577 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
YARSP54577 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
YARSP54577 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
YARSP54577 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
YARSP54577 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
YARSP54577 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
YARSP54577 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
YARSP54577 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
YARSP54577 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
YARSP54577 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
YARSP54577 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
YARSP54577 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
YARSP54577 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
YARSP54577 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
YARSP54577 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
YARSP54577 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
YARSP54577 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
YARSP54577 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
YARSP54577 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
YARSP54577 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
YARSP54577 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
YARSP54577 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
YARSP54577 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
YARSP54577 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
YARSP54577 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
YARSP54577 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
YARSP54577 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
YARSP54577 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
YARSP54577 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
YARSP54577 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
YARSP54577 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
YARSP54577 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
YARSP54577 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
YARSP54577 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
YARSP54577 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
YARSP54577 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
YARSP54577 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
YARSP54577 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
YARSP54577 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
YARSP54577 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
YARSP54577 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
YARSP54577 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
YARSP54577 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
YARSP54577 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
YARSP54577 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
YARSP54577 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
YARSP54577 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
YARSP54577 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
YARSP54577 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
YARSP54577 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
YARSP54577 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
YARSP54577 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
YARSP54577 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
YARSP54577 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
YARSP54577 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
YARSP54577 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
YARSP54577 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
YARSP54577 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
YARSP54577 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
YARSP54577 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
YARSP54577 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
YARSP54577 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
YARSP54577 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
YARSP54577 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
YARSP54577 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
YARSP54577 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms