Protein–RNA interactions for Protein: P51693

APLP1, Amyloid-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 650 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APLP1P51693 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
APLP1P51693 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
APLP1P51693 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
APLP1P51693 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
APLP1P51693 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
APLP1P51693 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
APLP1P51693 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
APLP1P51693 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
APLP1P51693 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
APLP1P51693 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
APLP1P51693 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
APLP1P51693 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
APLP1P51693 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
APLP1P51693 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
APLP1P51693 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
APLP1P51693 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
APLP1P51693 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
APLP1P51693 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
APLP1P51693 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
APLP1P51693 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
APLP1P51693 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
APLP1P51693 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
APLP1P51693 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
APLP1P51693 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
APLP1P51693 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
APLP1P51693 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
APLP1P51693 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
APLP1P51693 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
APLP1P51693 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
APLP1P51693 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
APLP1P51693 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
APLP1P51693 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
APLP1P51693 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
APLP1P51693 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
APLP1P51693 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
APLP1P51693 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
APLP1P51693 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
APLP1P51693 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
APLP1P51693 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
APLP1P51693 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
APLP1P51693 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
APLP1P51693 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
APLP1P51693 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
APLP1P51693 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
APLP1P51693 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
APLP1P51693 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
APLP1P51693 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
APLP1P51693 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
APLP1P51693 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
APLP1P51693 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
APLP1P51693 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
APLP1P51693 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
APLP1P51693 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
APLP1P51693 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
APLP1P51693 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
APLP1P51693 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
APLP1P51693 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
APLP1P51693 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
APLP1P51693 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
APLP1P51693 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
APLP1P51693 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
APLP1P51693 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
APLP1P51693 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
APLP1P51693 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
APLP1P51693 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
APLP1P51693 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
APLP1P51693 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
APLP1P51693 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
APLP1P51693 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
APLP1P51693 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
APLP1P51693 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
APLP1P51693 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
APLP1P51693 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
APLP1P51693 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
APLP1P51693 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
APLP1P51693 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
APLP1P51693 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
APLP1P51693 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
APLP1P51693 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
APLP1P51693 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
APLP1P51693 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
APLP1P51693 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
APLP1P51693 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
APLP1P51693 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
APLP1P51693 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
APLP1P51693 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
APLP1P51693 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
APLP1P51693 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
APLP1P51693 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
APLP1P51693 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
APLP1P51693 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
APLP1P51693 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
APLP1P51693 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
APLP1P51693 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
APLP1P51693 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
APLP1P51693 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
APLP1P51693 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
APLP1P51693 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
APLP1P51693 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
APLP1P51693 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms