Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
SMARCA4P51532 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC44.73■■■■■ 4.75
SMARCA4P51532 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
SMARCA4P51532 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
SMARCA4P51532 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC44.73■■■■■ 4.75
SMARCA4P51532 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC44.72■■■■■ 4.75
SMARCA4P51532 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC44.72■■■■■ 4.75
SMARCA4P51532 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
SMARCA4P51532 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
SMARCA4P51532 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
SMARCA4P51532 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
SMARCA4P51532 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
SMARCA4P51532 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC44.7■■■■■ 4.75
SMARCA4P51532 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC44.7■■■■■ 4.75
SMARCA4P51532 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC44.69■■■■■ 4.75
SMARCA4P51532 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.75
SMARCA4P51532 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC44.69■■■■■ 4.74
SMARCA4P51532 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC44.69■■■■■ 4.74
SMARCA4P51532 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
SMARCA4P51532 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
SMARCA4P51532 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
SMARCA4P51532 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC44.67■■■■■ 4.74
SMARCA4P51532 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC44.66■■■■■ 4.74
SMARCA4P51532 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC44.66■■■■■ 4.74
SMARCA4P51532 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC44.66■■■■■ 4.74
SMARCA4P51532 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC44.66■■■■■ 4.74
SMARCA4P51532 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC44.66■■■■■ 4.74
SMARCA4P51532 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC44.66■■■■■ 4.74
SMARCA4P51532 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
SMARCA4P51532 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
SMARCA4P51532 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
SMARCA4P51532 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
SMARCA4P51532 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
SMARCA4P51532 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC44.64■■■■■ 4.74
SMARCA4P51532 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC44.64■■■■■ 4.74
SMARCA4P51532 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.63■■■■■ 4.74
SMARCA4P51532 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC44.63■■■■■ 4.74
SMARCA4P51532 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC44.63■■■■■ 4.73
SMARCA4P51532 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC44.63■■■■■ 4.73
SMARCA4P51532 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.63■■■■■ 4.73
SMARCA4P51532 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC44.62■■■■■ 4.73
SMARCA4P51532 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
SMARCA4P51532 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC44.61■■■■■ 4.73
SMARCA4P51532 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC44.61■■■■■ 4.73
SMARCA4P51532 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC44.6■■■■■ 4.73
SMARCA4P51532 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC44.6■■■■■ 4.73
SMARCA4P51532 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC44.6■■■■■ 4.73
SMARCA4P51532 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC44.59■■■■■ 4.73
SMARCA4P51532 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC44.59■■■■■ 4.73
SMARCA4P51532 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC44.59■■■■■ 4.73
SMARCA4P51532 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
SMARCA4P51532 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
SMARCA4P51532 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
SMARCA4P51532 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC44.58■■■■■ 4.73
SMARCA4P51532 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC44.57■■■■■ 4.73
SMARCA4P51532 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.73
SMARCA4P51532 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.73
SMARCA4P51532 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC44.57■■■■■ 4.73
SMARCA4P51532 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.72
SMARCA4P51532 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
SMARCA4P51532 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC44.55■■■■■ 4.72
SMARCA4P51532 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC44.55■■■■■ 4.72
SMARCA4P51532 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC44.55■■■■■ 4.72
SMARCA4P51532 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.55■■■■■ 4.72
SMARCA4P51532 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC44.55■■■■■ 4.72
SMARCA4P51532 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
SMARCA4P51532 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.54■■■■■ 4.72
SMARCA4P51532 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC44.54■■■■■ 4.72
SMARCA4P51532 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.54■■■■■ 4.72
SMARCA4P51532 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC44.53■■■■■ 4.72
SMARCA4P51532 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
SMARCA4P51532 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC44.53■■■■■ 4.72
SMARCA4P51532 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC44.53■■■■■ 4.72
SMARCA4P51532 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC44.53■■■■■ 4.72
SMARCA4P51532 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC44.53■■■■■ 4.72
SMARCA4P51532 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
SMARCA4P51532 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
SMARCA4P51532 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
SMARCA4P51532 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
SMARCA4P51532 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.52■■■■■ 4.72
SMARCA4P51532 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.52■■■■■ 4.72
SMARCA4P51532 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.51■■■■■ 4.72
SMARCA4P51532 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC44.51■■■■■ 4.72
SMARCA4P51532 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC44.51■■■■■ 4.72
SMARCA4P51532 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC44.51■■■■■ 4.72
SMARCA4P51532 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.51■■■■■ 4.72
SMARCA4P51532 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
SMARCA4P51532 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
SMARCA4P51532 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC44.5■■■■■ 4.71
SMARCA4P51532 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC44.5■■■■■ 4.71
SMARCA4P51532 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC44.5■■■■■ 4.71
SMARCA4P51532 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.49■■■■■ 4.71
SMARCA4P51532 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
SMARCA4P51532 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
SMARCA4P51532 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
SMARCA4P51532 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.46■■■■■ 4.71
SMARCA4P51532 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC44.46■■■■■ 4.71
SMARCA4P51532 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
SMARCA4P51532 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC44.45■■■■■ 4.71
SMARCA4P51532 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms