Protein–RNA interactions for Protein: P48539

PCP4, Calmodulin regulator protein PCP4, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCP4P48539 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCP4P48539 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCP4P48539 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCP4P48539 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCP4P48539 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCP4P48539 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCP4P48539 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCP4P48539 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCP4P48539 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCP4P48539 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCP4P48539 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCP4P48539 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCP4P48539 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCP4P48539 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCP4P48539 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCP4P48539 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCP4P48539 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCP4P48539 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCP4P48539 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCP4P48539 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCP4P48539 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCP4P48539 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCP4P48539 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCP4P48539 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCP4P48539 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCP4P48539 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCP4P48539 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCP4P48539 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCP4P48539 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCP4P48539 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCP4P48539 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCP4P48539 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCP4P48539 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PCP4P48539 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCP4P48539 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCP4P48539 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCP4P48539 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCP4P48539 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCP4P48539 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCP4P48539 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCP4P48539 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCP4P48539 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCP4P48539 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCP4P48539 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCP4P48539 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCP4P48539 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCP4P48539 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCP4P48539 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCP4P48539 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCP4P48539 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCP4P48539 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCP4P48539 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCP4P48539 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCP4P48539 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCP4P48539 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCP4P48539 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCP4P48539 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCP4P48539 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCP4P48539 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCP4P48539 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCP4P48539 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCP4P48539 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCP4P48539 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCP4P48539 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCP4P48539 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCP4P48539 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCP4P48539 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCP4P48539 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCP4P48539 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCP4P48539 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCP4P48539 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCP4P48539 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCP4P48539 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCP4P48539 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCP4P48539 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCP4P48539 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCP4P48539 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCP4P48539 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCP4P48539 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCP4P48539 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCP4P48539 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCP4P48539 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PCP4P48539 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PCP4P48539 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PCP4P48539 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCP4P48539 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCP4P48539 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCP4P48539 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCP4P48539 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCP4P48539 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCP4P48539 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCP4P48539 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCP4P48539 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCP4P48539 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PCP4P48539 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCP4P48539 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCP4P48539 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCP4P48539 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PCP4P48539 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PCP4P48539 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 181.4 ms