Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRCC3P46736 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRCC3P46736 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRCC3P46736 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRCC3P46736 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRCC3P46736 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRCC3P46736 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRCC3P46736 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRCC3P46736 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRCC3P46736 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
BRCC3P46736 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRCC3P46736 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRCC3P46736 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRCC3P46736 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BRCC3P46736 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
BRCC3P46736 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BRCC3P46736 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRCC3P46736 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRCC3P46736 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
BRCC3P46736 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRCC3P46736 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRCC3P46736 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRCC3P46736 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRCC3P46736 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRCC3P46736 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRCC3P46736 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRCC3P46736 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRCC3P46736 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRCC3P46736 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRCC3P46736 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRCC3P46736 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRCC3P46736 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRCC3P46736 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRCC3P46736 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRCC3P46736 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRCC3P46736 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRCC3P46736 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRCC3P46736 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRCC3P46736 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRCC3P46736 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
BRCC3P46736 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRCC3P46736 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRCC3P46736 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRCC3P46736 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRCC3P46736 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRCC3P46736 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRCC3P46736 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
BRCC3P46736 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRCC3P46736 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRCC3P46736 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRCC3P46736 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRCC3P46736 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRCC3P46736 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRCC3P46736 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRCC3P46736 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRCC3P46736 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRCC3P46736 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
BRCC3P46736 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRCC3P46736 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRCC3P46736 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRCC3P46736 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRCC3P46736 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRCC3P46736 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
BRCC3P46736 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRCC3P46736 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRCC3P46736 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRCC3P46736 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRCC3P46736 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRCC3P46736 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRCC3P46736 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRCC3P46736 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
BRCC3P46736 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRCC3P46736 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRCC3P46736 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRCC3P46736 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRCC3P46736 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRCC3P46736 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRCC3P46736 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRCC3P46736 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRCC3P46736 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRCC3P46736 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRCC3P46736 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRCC3P46736 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
BRCC3P46736 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BRCC3P46736 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BRCC3P46736 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
BRCC3P46736 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
BRCC3P46736 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
BRCC3P46736 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRCC3P46736 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRCC3P46736 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRCC3P46736 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRCC3P46736 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRCC3P46736 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRCC3P46736 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRCC3P46736 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRCC3P46736 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRCC3P46736 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRCC3P46736 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRCC3P46736 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms