Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPD2P43304 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPD2P43304 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPD2P43304 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPD2P43304 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPD2P43304 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPD2P43304 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPD2P43304 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPD2P43304 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPD2P43304 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPD2P43304 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPD2P43304 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPD2P43304 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPD2P43304 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPD2P43304 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPD2P43304 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPD2P43304 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPD2P43304 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GPD2P43304 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GPD2P43304 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GPD2P43304 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GPD2P43304 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPD2P43304 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPD2P43304 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPD2P43304 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPD2P43304 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPD2P43304 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPD2P43304 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPD2P43304 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
GPD2P43304 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GPD2P43304 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GPD2P43304 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GPD2P43304 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GPD2P43304 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPD2P43304 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPD2P43304 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPD2P43304 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GPD2P43304 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GPD2P43304 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GPD2P43304 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPD2P43304 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPD2P43304 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPD2P43304 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPD2P43304 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
GPD2P43304 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPD2P43304 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPD2P43304 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPD2P43304 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPD2P43304 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPD2P43304 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPD2P43304 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPD2P43304 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPD2P43304 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPD2P43304 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPD2P43304 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPD2P43304 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GPD2P43304 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPD2P43304 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPD2P43304 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GPD2P43304 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPD2P43304 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPD2P43304 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPD2P43304 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPD2P43304 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPD2P43304 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GPD2P43304 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GPD2P43304 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPD2P43304 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPD2P43304 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPD2P43304 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GPD2P43304 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPD2P43304 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPD2P43304 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GPD2P43304 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPD2P43304 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPD2P43304 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPD2P43304 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPD2P43304 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPD2P43304 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPD2P43304 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPD2P43304 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPD2P43304 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPD2P43304 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPD2P43304 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPD2P43304 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPD2P43304 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPD2P43304 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GPD2P43304 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GPD2P43304 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GPD2P43304 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
GPD2P43304 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPD2P43304 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPD2P43304 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPD2P43304 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPD2P43304 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GPD2P43304 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GPD2P43304 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GPD2P43304 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GPD2P43304 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GPD2P43304 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms