Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
MCAMP43121 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
MCAMP43121 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
MCAMP43121 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
MCAMP43121 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
MCAMP43121 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
MCAMP43121 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
MCAMP43121 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MCAMP43121 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MCAMP43121 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
MCAMP43121 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
MCAMP43121 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
MCAMP43121 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
MCAMP43121 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
MCAMP43121 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
MCAMP43121 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
MCAMP43121 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
MCAMP43121 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
MCAMP43121 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MCAMP43121 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MCAMP43121 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
MCAMP43121 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
MCAMP43121 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MCAMP43121 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MCAMP43121 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
MCAMP43121 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MCAMP43121 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
MCAMP43121 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MCAMP43121 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
MCAMP43121 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MCAMP43121 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MCAMP43121 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MCAMP43121 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
MCAMP43121 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
MCAMP43121 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
MCAMP43121 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
MCAMP43121 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
MCAMP43121 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
MCAMP43121 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
MCAMP43121 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
MCAMP43121 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
MCAMP43121 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
MCAMP43121 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
MCAMP43121 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
MCAMP43121 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
MCAMP43121 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
MCAMP43121 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MCAMP43121 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MCAMP43121 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
MCAMP43121 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MCAMP43121 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MCAMP43121 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MCAMP43121 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MCAMP43121 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
MCAMP43121 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
MCAMP43121 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
MCAMP43121 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MCAMP43121 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
MCAMP43121 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MCAMP43121 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MCAMP43121 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MCAMP43121 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MCAMP43121 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
MCAMP43121 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MCAMP43121 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MCAMP43121 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
MCAMP43121 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MCAMP43121 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MCAMP43121 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MCAMP43121 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MCAMP43121 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
MCAMP43121 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
MCAMP43121 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
MCAMP43121 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
MCAMP43121 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MCAMP43121 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
MCAMP43121 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
MCAMP43121 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
MCAMP43121 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
MCAMP43121 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MCAMP43121 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MCAMP43121 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MCAMP43121 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MCAMP43121 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MCAMP43121 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MCAMP43121 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
MCAMP43121 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MCAMP43121 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MCAMP43121 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MCAMP43121 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MCAMP43121 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MCAMP43121 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MCAMP43121 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MCAMP43121 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MCAMP43121 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MCAMP43121 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MCAMP43121 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MCAMP43121 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MCAMP43121 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MCAMP43121 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms