Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
KDM5CP41229 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC37.3■■■■□ 3.56
KDM5CP41229 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
KDM5CP41229 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
KDM5CP41229 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
KDM5CP41229 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
KDM5CP41229 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
KDM5CP41229 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
KDM5CP41229 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
KDM5CP41229 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
KDM5CP41229 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
KDM5CP41229 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
KDM5CP41229 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
KDM5CP41229 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
KDM5CP41229 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC37.25■■■■□ 3.55
KDM5CP41229 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
KDM5CP41229 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
KDM5CP41229 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
KDM5CP41229 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
KDM5CP41229 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
KDM5CP41229 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
KDM5CP41229 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
KDM5CP41229 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
KDM5CP41229 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
KDM5CP41229 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
KDM5CP41229 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
KDM5CP41229 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
KDM5CP41229 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
KDM5CP41229 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
KDM5CP41229 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
KDM5CP41229 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC37.19■■■■□ 3.54
KDM5CP41229 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
KDM5CP41229 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
KDM5CP41229 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
KDM5CP41229 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
KDM5CP41229 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
KDM5CP41229 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
KDM5CP41229 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
KDM5CP41229 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
KDM5CP41229 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
KDM5CP41229 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
KDM5CP41229 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
KDM5CP41229 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
KDM5CP41229 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
KDM5CP41229 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
KDM5CP41229 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
KDM5CP41229 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
KDM5CP41229 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
KDM5CP41229 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
KDM5CP41229 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
KDM5CP41229 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
KDM5CP41229 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
KDM5CP41229 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
KDM5CP41229 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
KDM5CP41229 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
KDM5CP41229 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
KDM5CP41229 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
KDM5CP41229 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC37.13■■■■□ 3.53
KDM5CP41229 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
KDM5CP41229 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
KDM5CP41229 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
KDM5CP41229 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
KDM5CP41229 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
KDM5CP41229 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
KDM5CP41229 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
KDM5CP41229 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
KDM5CP41229 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.11■■■■□ 3.53
KDM5CP41229 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
KDM5CP41229 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
KDM5CP41229 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
KDM5CP41229 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
KDM5CP41229 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
KDM5CP41229 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
KDM5CP41229 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
KDM5CP41229 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
KDM5CP41229 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC37.08■■■■□ 3.53
KDM5CP41229 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
KDM5CP41229 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC37.08■■■■□ 3.53
KDM5CP41229 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
KDM5CP41229 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
KDM5CP41229 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
KDM5CP41229 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
KDM5CP41229 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
KDM5CP41229 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
KDM5CP41229 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
KDM5CP41229 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
KDM5CP41229 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
KDM5CP41229 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
KDM5CP41229 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
KDM5CP41229 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
KDM5CP41229 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
KDM5CP41229 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
KDM5CP41229 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
KDM5CP41229 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC37.05■■■■□ 3.52
KDM5CP41229 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC37.05■■■■□ 3.52
KDM5CP41229 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
KDM5CP41229 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
KDM5CP41229 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
KDM5CP41229 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
KDM5CP41229 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms