Protein–RNA interactions for Protein: P41219

PRPH, Peripherin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPHP41219 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRPHP41219 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRPHP41219 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRPHP41219 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PRPHP41219 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRPHP41219 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRPHP41219 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRPHP41219 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRPHP41219 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRPHP41219 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRPHP41219 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRPHP41219 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PRPHP41219 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRPHP41219 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRPHP41219 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRPHP41219 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRPHP41219 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRPHP41219 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRPHP41219 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRPHP41219 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRPHP41219 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRPHP41219 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRPHP41219 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRPHP41219 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRPHP41219 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PRPHP41219 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
PRPHP41219 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRPHP41219 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
PRPHP41219 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRPHP41219 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRPHP41219 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PRPHP41219 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PRPHP41219 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PRPHP41219 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PRPHP41219 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PRPHP41219 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRPHP41219 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRPHP41219 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRPHP41219 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRPHP41219 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PRPHP41219 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRPHP41219 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PRPHP41219 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PRPHP41219 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRPHP41219 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PRPHP41219 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
PRPHP41219 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRPHP41219 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PRPHP41219 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PRPHP41219 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
PRPHP41219 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PRPHP41219 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRPHP41219 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRPHP41219 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRPHP41219 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRPHP41219 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRPHP41219 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRPHP41219 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRPHP41219 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRPHP41219 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRPHP41219 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRPHP41219 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRPHP41219 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRPHP41219 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PRPHP41219 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRPHP41219 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRPHP41219 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRPHP41219 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRPHP41219 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRPHP41219 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRPHP41219 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRPHP41219 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PRPHP41219 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRPHP41219 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRPHP41219 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRPHP41219 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRPHP41219 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRPHP41219 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRPHP41219 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRPHP41219 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRPHP41219 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRPHP41219 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRPHP41219 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRPHP41219 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRPHP41219 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRPHP41219 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRPHP41219 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRPHP41219 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRPHP41219 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRPHP41219 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRPHP41219 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRPHP41219 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPHP41219 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPHP41219 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPHP41219 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRPHP41219 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRPHP41219 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRPHP41219 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRPHP41219 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRPHP41219 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms