Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PBX2P40425 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PBX2P40425 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PBX2P40425 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PBX2P40425 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PBX2P40425 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PBX2P40425 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PBX2P40425 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PBX2P40425 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PBX2P40425 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PBX2P40425 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PBX2P40425 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PBX2P40425 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PBX2P40425 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PBX2P40425 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PBX2P40425 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PBX2P40425 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PBX2P40425 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PBX2P40425 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PBX2P40425 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PBX2P40425 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PBX2P40425 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PBX2P40425 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PBX2P40425 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PBX2P40425 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PBX2P40425 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PBX2P40425 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PBX2P40425 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PBX2P40425 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PBX2P40425 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PBX2P40425 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PBX2P40425 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PBX2P40425 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PBX2P40425 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PBX2P40425 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PBX2P40425 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PBX2P40425 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PBX2P40425 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PBX2P40425 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PBX2P40425 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PBX2P40425 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PBX2P40425 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PBX2P40425 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PBX2P40425 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PBX2P40425 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PBX2P40425 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PBX2P40425 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PBX2P40425 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PBX2P40425 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PBX2P40425 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PBX2P40425 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PBX2P40425 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PBX2P40425 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PBX2P40425 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PBX2P40425 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PBX2P40425 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PBX2P40425 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PBX2P40425 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PBX2P40425 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PBX2P40425 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PBX2P40425 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PBX2P40425 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PBX2P40425 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PBX2P40425 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PBX2P40425 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PBX2P40425 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PBX2P40425 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PBX2P40425 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PBX2P40425 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PBX2P40425 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PBX2P40425 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PBX2P40425 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PBX2P40425 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PBX2P40425 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PBX2P40425 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PBX2P40425 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PBX2P40425 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PBX2P40425 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PBX2P40425 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PBX2P40425 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PBX2P40425 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PBX2P40425 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PBX2P40425 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PBX2P40425 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PBX2P40425 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PBX2P40425 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PBX2P40425 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PBX2P40425 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PBX2P40425 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PBX2P40425 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PBX2P40425 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PBX2P40425 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PBX2P40425 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PBX2P40425 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PBX2P40425 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PBX2P40425 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PBX2P40425 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PBX2P40425 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PBX2P40425 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PBX2P40425 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms