Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LTBRP36941 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LTBRP36941 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LTBRP36941 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LTBRP36941 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LTBRP36941 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LTBRP36941 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LTBRP36941 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
LTBRP36941 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LTBRP36941 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LTBRP36941 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LTBRP36941 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LTBRP36941 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LTBRP36941 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LTBRP36941 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LTBRP36941 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LTBRP36941 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LTBRP36941 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LTBRP36941 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LTBRP36941 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LTBRP36941 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LTBRP36941 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LTBRP36941 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LTBRP36941 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LTBRP36941 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LTBRP36941 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LTBRP36941 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LTBRP36941 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LTBRP36941 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LTBRP36941 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LTBRP36941 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LTBRP36941 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LTBRP36941 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LTBRP36941 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LTBRP36941 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LTBRP36941 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LTBRP36941 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LTBRP36941 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LTBRP36941 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LTBRP36941 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LTBRP36941 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LTBRP36941 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LTBRP36941 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LTBRP36941 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LTBRP36941 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LTBRP36941 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LTBRP36941 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LTBRP36941 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LTBRP36941 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LTBRP36941 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LTBRP36941 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LTBRP36941 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LTBRP36941 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LTBRP36941 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LTBRP36941 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LTBRP36941 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LTBRP36941 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LTBRP36941 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LTBRP36941 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LTBRP36941 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LTBRP36941 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LTBRP36941 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LTBRP36941 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LTBRP36941 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LTBRP36941 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LTBRP36941 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LTBRP36941 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LTBRP36941 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LTBRP36941 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LTBRP36941 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LTBRP36941 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LTBRP36941 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LTBRP36941 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LTBRP36941 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LTBRP36941 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LTBRP36941 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LTBRP36941 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LTBRP36941 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LTBRP36941 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LTBRP36941 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LTBRP36941 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LTBRP36941 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LTBRP36941 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LTBRP36941 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LTBRP36941 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LTBRP36941 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LTBRP36941 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
LTBRP36941 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LTBRP36941 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LTBRP36941 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LTBRP36941 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LTBRP36941 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LTBRP36941 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LTBRP36941 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LTBRP36941 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LTBRP36941 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LTBRP36941 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
LTBRP36941 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
LTBRP36941 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
LTBRP36941 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms