Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXD13P35453 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXD13P35453 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXD13P35453 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXD13P35453 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXD13P35453 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXD13P35453 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXD13P35453 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXD13P35453 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXD13P35453 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXD13P35453 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXD13P35453 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXD13P35453 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXD13P35453 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXD13P35453 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXD13P35453 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXD13P35453 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXD13P35453 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXD13P35453 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXD13P35453 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXD13P35453 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXD13P35453 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXD13P35453 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXD13P35453 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXD13P35453 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXD13P35453 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXD13P35453 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXD13P35453 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXD13P35453 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXD13P35453 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXD13P35453 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXD13P35453 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXD13P35453 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXD13P35453 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXD13P35453 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXD13P35453 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXD13P35453 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXD13P35453 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXD13P35453 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXD13P35453 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXD13P35453 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXD13P35453 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXD13P35453 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXD13P35453 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXD13P35453 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXD13P35453 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXD13P35453 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXD13P35453 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXD13P35453 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXD13P35453 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXD13P35453 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXD13P35453 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXD13P35453 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXD13P35453 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXD13P35453 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXD13P35453 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXD13P35453 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXD13P35453 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXD13P35453 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXD13P35453 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXD13P35453 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXD13P35453 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXD13P35453 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXD13P35453 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXD13P35453 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXD13P35453 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXD13P35453 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXD13P35453 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXD13P35453 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXD13P35453 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXD13P35453 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXD13P35453 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXD13P35453 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXD13P35453 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXD13P35453 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXD13P35453 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXD13P35453 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXD13P35453 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXD13P35453 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXD13P35453 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXD13P35453 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
HOXD13P35453 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
HOXD13P35453 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXD13P35453 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXD13P35453 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXD13P35453 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXD13P35453 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXD13P35453 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXD13P35453 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXD13P35453 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXD13P35453 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXD13P35453 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXD13P35453 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXD13P35453 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXD13P35453 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXD13P35453 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXD13P35453 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXD13P35453 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXD13P35453 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXD13P35453 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms