Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTX2P32243 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTX2P32243 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTX2P32243 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTX2P32243 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTX2P32243 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
OTX2P32243 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTX2P32243 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
OTX2P32243 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTX2P32243 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTX2P32243 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTX2P32243 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTX2P32243 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTX2P32243 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
OTX2P32243 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTX2P32243 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTX2P32243 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTX2P32243 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTX2P32243 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTX2P32243 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
OTX2P32243 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTX2P32243 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTX2P32243 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTX2P32243 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTX2P32243 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTX2P32243 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTX2P32243 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTX2P32243 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTX2P32243 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTX2P32243 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTX2P32243 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTX2P32243 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTX2P32243 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTX2P32243 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTX2P32243 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTX2P32243 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTX2P32243 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTX2P32243 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
OTX2P32243 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTX2P32243 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTX2P32243 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTX2P32243 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTX2P32243 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
OTX2P32243 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTX2P32243 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTX2P32243 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTX2P32243 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTX2P32243 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTX2P32243 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTX2P32243 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTX2P32243 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTX2P32243 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTX2P32243 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTX2P32243 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTX2P32243 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTX2P32243 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTX2P32243 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTX2P32243 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTX2P32243 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTX2P32243 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTX2P32243 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTX2P32243 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTX2P32243 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTX2P32243 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTX2P32243 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
OTX2P32243 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTX2P32243 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTX2P32243 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTX2P32243 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTX2P32243 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTX2P32243 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTX2P32243 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTX2P32243 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTX2P32243 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTX2P32243 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTX2P32243 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTX2P32243 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTX2P32243 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTX2P32243 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTX2P32243 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTX2P32243 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTX2P32243 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTX2P32243 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTX2P32243 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTX2P32243 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTX2P32243 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTX2P32243 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTX2P32243 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTX2P32243 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTX2P32243 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTX2P32243 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTX2P32243 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTX2P32243 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTX2P32243 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTX2P32243 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTX2P32243 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTX2P32243 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTX2P32243 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTX2P32243 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTX2P32243 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms