Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXA13P31271 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXA13P31271 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXA13P31271 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HOXA13P31271 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HOXA13P31271 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HOXA13P31271 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HOXA13P31271 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HOXA13P31271 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HOXA13P31271 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HOXA13P31271 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HOXA13P31271 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HOXA13P31271 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HOXA13P31271 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HOXA13P31271 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HOXA13P31271 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HOXA13P31271 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HOXA13P31271 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HOXA13P31271 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HOXA13P31271 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HOXA13P31271 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HOXA13P31271 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HOXA13P31271 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HOXA13P31271 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HOXA13P31271 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HOXA13P31271 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HOXA13P31271 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HOXA13P31271 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HOXA13P31271 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HOXA13P31271 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HOXA13P31271 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HOXA13P31271 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HOXA13P31271 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HOXA13P31271 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HOXA13P31271 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HOXA13P31271 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HOXA13P31271 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HOXA13P31271 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HOXA13P31271 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HOXA13P31271 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HOXA13P31271 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HOXA13P31271 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HOXA13P31271 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HOXA13P31271 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HOXA13P31271 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HOXA13P31271 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HOXA13P31271 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXA13P31271 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXA13P31271 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXA13P31271 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXA13P31271 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXA13P31271 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXA13P31271 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXA13P31271 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXA13P31271 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXA13P31271 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXA13P31271 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXA13P31271 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXA13P31271 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXA13P31271 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXA13P31271 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXA13P31271 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXA13P31271 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXA13P31271 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXA13P31271 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXA13P31271 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXA13P31271 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXA13P31271 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXA13P31271 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXA13P31271 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HOXA13P31271 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HOXA13P31271 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HOXA13P31271 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
HOXA13P31271 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HOXA13P31271 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
HOXA13P31271 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HOXA13P31271 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
HOXA13P31271 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HOXA13P31271 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HOXA13P31271 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXA13P31271 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXA13P31271 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HOXA13P31271 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HOXA13P31271 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HOXA13P31271 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOXA13P31271 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOXA13P31271 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOXA13P31271 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOXA13P31271 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOXA13P31271 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXA13P31271 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXA13P31271 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXA13P31271 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXA13P31271 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXA13P31271 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXA13P31271 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
HOXA13P31271 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
HOXA13P31271 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HOXA13P31271 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HOXA13P31271 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms