Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXA11P31270 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXA11P31270 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
HOXA11P31270 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HOXA11P31270 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXA11P31270 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXA11P31270 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXA11P31270 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXA11P31270 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXA11P31270 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXA11P31270 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXA11P31270 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXA11P31270 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXA11P31270 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXA11P31270 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXA11P31270 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXA11P31270 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXA11P31270 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXA11P31270 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXA11P31270 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXA11P31270 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXA11P31270 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXA11P31270 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXA11P31270 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXA11P31270 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXA11P31270 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
HOXA11P31270 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
HOXA11P31270 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
HOXA11P31270 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
HOXA11P31270 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXA11P31270 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXA11P31270 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXA11P31270 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXA11P31270 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXA11P31270 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXA11P31270 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXA11P31270 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXA11P31270 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXA11P31270 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXA11P31270 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXA11P31270 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXA11P31270 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXA11P31270 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXA11P31270 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXA11P31270 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXA11P31270 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXA11P31270 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXA11P31270 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXA11P31270 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXA11P31270 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXA11P31270 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXA11P31270 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXA11P31270 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXA11P31270 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
HOXA11P31270 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXA11P31270 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXA11P31270 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXA11P31270 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXA11P31270 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXA11P31270 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXA11P31270 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXA11P31270 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXA11P31270 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXA11P31270 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXA11P31270 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXA11P31270 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXA11P31270 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXA11P31270 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXA11P31270 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXA11P31270 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXA11P31270 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXA11P31270 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXA11P31270 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXA11P31270 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXA11P31270 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXA11P31270 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXA11P31270 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXA11P31270 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXA11P31270 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXA11P31270 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXA11P31270 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXA11P31270 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXA11P31270 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXA11P31270 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXA11P31270 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXA11P31270 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXA11P31270 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXA11P31270 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXA11P31270 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXA11P31270 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXA11P31270 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXA11P31270 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXA11P31270 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXA11P31270 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXA11P31270 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXA11P31270 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXA11P31270 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXA11P31270 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXA11P31270 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXA11P31270 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms