Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CNGA1P29973 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CNGA1P29973 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CNGA1P29973 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CNGA1P29973 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CNGA1P29973 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CNGA1P29973 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNGA1P29973 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNGA1P29973 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CNGA1P29973 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNGA1P29973 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNGA1P29973 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CNGA1P29973 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNGA1P29973 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNGA1P29973 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNGA1P29973 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNGA1P29973 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNGA1P29973 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNGA1P29973 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNGA1P29973 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CNGA1P29973 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNGA1P29973 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNGA1P29973 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CNGA1P29973 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNGA1P29973 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNGA1P29973 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNGA1P29973 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNGA1P29973 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
CNGA1P29973 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CNGA1P29973 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNGA1P29973 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNGA1P29973 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNGA1P29973 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNGA1P29973 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNGA1P29973 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNGA1P29973 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNGA1P29973 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNGA1P29973 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CNGA1P29973 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNGA1P29973 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNGA1P29973 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNGA1P29973 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNGA1P29973 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNGA1P29973 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNGA1P29973 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNGA1P29973 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNGA1P29973 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNGA1P29973 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNGA1P29973 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNGA1P29973 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNGA1P29973 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNGA1P29973 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNGA1P29973 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNGA1P29973 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CNGA1P29973 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNGA1P29973 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNGA1P29973 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNGA1P29973 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNGA1P29973 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNGA1P29973 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNGA1P29973 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNGA1P29973 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNGA1P29973 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNGA1P29973 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNGA1P29973 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNGA1P29973 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNGA1P29973 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CNGA1P29973 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNGA1P29973 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNGA1P29973 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNGA1P29973 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNGA1P29973 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNGA1P29973 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNGA1P29973 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNGA1P29973 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNGA1P29973 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNGA1P29973 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNGA1P29973 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNGA1P29973 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNGA1P29973 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNGA1P29973 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNGA1P29973 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNGA1P29973 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNGA1P29973 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNGA1P29973 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CNGA1P29973 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CNGA1P29973 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CNGA1P29973 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CNGA1P29973 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CNGA1P29973 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CNGA1P29973 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CNGA1P29973 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNGA1P29973 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNGA1P29973 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNGA1P29973 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNGA1P29973 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNGA1P29973 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNGA1P29973 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNGA1P29973 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNGA1P29973 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms