Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTX3P26022 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTX3P26022 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTX3P26022 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTX3P26022 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTX3P26022 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTX3P26022 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTX3P26022 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PTX3P26022 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTX3P26022 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTX3P26022 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTX3P26022 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTX3P26022 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTX3P26022 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTX3P26022 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTX3P26022 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTX3P26022 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTX3P26022 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTX3P26022 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTX3P26022 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTX3P26022 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTX3P26022 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTX3P26022 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTX3P26022 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTX3P26022 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTX3P26022 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTX3P26022 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTX3P26022 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTX3P26022 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTX3P26022 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PTX3P26022 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTX3P26022 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTX3P26022 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTX3P26022 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTX3P26022 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTX3P26022 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTX3P26022 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTX3P26022 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTX3P26022 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PTX3P26022 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTX3P26022 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTX3P26022 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTX3P26022 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTX3P26022 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTX3P26022 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTX3P26022 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTX3P26022 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTX3P26022 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PTX3P26022 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTX3P26022 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTX3P26022 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
PTX3P26022 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTX3P26022 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTX3P26022 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTX3P26022 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTX3P26022 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTX3P26022 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTX3P26022 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTX3P26022 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTX3P26022 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTX3P26022 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTX3P26022 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTX3P26022 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTX3P26022 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTX3P26022 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PTX3P26022 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTX3P26022 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTX3P26022 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTX3P26022 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTX3P26022 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTX3P26022 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTX3P26022 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTX3P26022 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTX3P26022 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTX3P26022 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTX3P26022 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTX3P26022 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTX3P26022 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTX3P26022 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTX3P26022 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTX3P26022 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTX3P26022 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTX3P26022 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTX3P26022 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PTX3P26022 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PTX3P26022 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTX3P26022 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PTX3P26022 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTX3P26022 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTX3P26022 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTX3P26022 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTX3P26022 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTX3P26022 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTX3P26022 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTX3P26022 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTX3P26022 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTX3P26022 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTX3P26022 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTX3P26022 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTX3P26022 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 240 ms