Protein–RNA interactions for Protein: P22735

TGM1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM1P22735 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TGM1P22735 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TGM1P22735 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TGM1P22735 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TGM1P22735 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TGM1P22735 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TGM1P22735 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TGM1P22735 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TGM1P22735 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TGM1P22735 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TGM1P22735 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TGM1P22735 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TGM1P22735 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TGM1P22735 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TGM1P22735 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TGM1P22735 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TGM1P22735 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TGM1P22735 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TGM1P22735 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TGM1P22735 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TGM1P22735 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TGM1P22735 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TGM1P22735 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TGM1P22735 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TGM1P22735 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TGM1P22735 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TGM1P22735 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TGM1P22735 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TGM1P22735 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TGM1P22735 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TGM1P22735 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TGM1P22735 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TGM1P22735 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TGM1P22735 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TGM1P22735 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TGM1P22735 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TGM1P22735 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TGM1P22735 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TGM1P22735 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TGM1P22735 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TGM1P22735 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TGM1P22735 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TGM1P22735 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TGM1P22735 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TGM1P22735 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TGM1P22735 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TGM1P22735 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TGM1P22735 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TGM1P22735 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TGM1P22735 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TGM1P22735 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TGM1P22735 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TGM1P22735 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TGM1P22735 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TGM1P22735 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TGM1P22735 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TGM1P22735 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TGM1P22735 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TGM1P22735 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TGM1P22735 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TGM1P22735 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TGM1P22735 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TGM1P22735 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TGM1P22735 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TGM1P22735 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TGM1P22735 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TGM1P22735 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TGM1P22735 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TGM1P22735 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TGM1P22735 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TGM1P22735 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TGM1P22735 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TGM1P22735 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TGM1P22735 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TGM1P22735 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TGM1P22735 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TGM1P22735 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TGM1P22735 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TGM1P22735 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TGM1P22735 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TGM1P22735 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TGM1P22735 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TGM1P22735 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TGM1P22735 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TGM1P22735 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TGM1P22735 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TGM1P22735 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TGM1P22735 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TGM1P22735 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TGM1P22735 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TGM1P22735 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TGM1P22735 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TGM1P22735 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TGM1P22735 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TGM1P22735 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TGM1P22735 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TGM1P22735 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TGM1P22735 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TGM1P22735 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TGM1P22735 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.5 ms