Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FGFR3P22607 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FGFR3P22607 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FGFR3P22607 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FGFR3P22607 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FGFR3P22607 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
FGFR3P22607 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FGFR3P22607 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FGFR3P22607 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FGFR3P22607 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FGFR3P22607 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FGFR3P22607 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FGFR3P22607 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FGFR3P22607 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FGFR3P22607 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FGFR3P22607 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FGFR3P22607 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FGFR3P22607 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FGFR3P22607 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FGFR3P22607 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FGFR3P22607 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FGFR3P22607 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FGFR3P22607 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FGFR3P22607 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FGFR3P22607 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FGFR3P22607 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FGFR3P22607 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FGFR3P22607 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
FGFR3P22607 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FGFR3P22607 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FGFR3P22607 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FGFR3P22607 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FGFR3P22607 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FGFR3P22607 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FGFR3P22607 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FGFR3P22607 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FGFR3P22607 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FGFR3P22607 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26■■□□□ 1.75
FGFR3P22607 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FGFR3P22607 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FGFR3P22607 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
FGFR3P22607 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
FGFR3P22607 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FGFR3P22607 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FGFR3P22607 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FGFR3P22607 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
FGFR3P22607 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FGFR3P22607 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FGFR3P22607 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FGFR3P22607 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FGFR3P22607 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FGFR3P22607 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FGFR3P22607 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FGFR3P22607 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FGFR3P22607 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FGFR3P22607 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FGFR3P22607 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FGFR3P22607 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
FGFR3P22607 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FGFR3P22607 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
FGFR3P22607 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FGFR3P22607 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FGFR3P22607 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FGFR3P22607 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
FGFR3P22607 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FGFR3P22607 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FGFR3P22607 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FGFR3P22607 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FGFR3P22607 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
FGFR3P22607 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FGFR3P22607 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FGFR3P22607 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FGFR3P22607 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FGFR3P22607 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FGFR3P22607 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FGFR3P22607 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FGFR3P22607 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FGFR3P22607 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FGFR3P22607 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FGFR3P22607 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FGFR3P22607 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FGFR3P22607 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FGFR3P22607 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FGFR3P22607 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
FGFR3P22607 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FGFR3P22607 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FGFR3P22607 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FGFR3P22607 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FGFR3P22607 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
FGFR3P22607 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FGFR3P22607 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
FGFR3P22607 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FGFR3P22607 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
FGFR3P22607 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FGFR3P22607 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FGFR3P22607 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FGFR3P22607 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FGFR3P22607 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
FGFR3P22607 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FGFR3P22607 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms