Protein–RNA interactions for Protein: P22460

KCNA5, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 5, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA5P22460 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNA5P22460 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNA5P22460 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNA5P22460 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNA5P22460 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNA5P22460 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNA5P22460 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNA5P22460 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNA5P22460 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNA5P22460 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNA5P22460 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNA5P22460 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNA5P22460 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNA5P22460 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNA5P22460 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNA5P22460 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNA5P22460 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNA5P22460 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNA5P22460 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNA5P22460 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNA5P22460 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNA5P22460 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNA5P22460 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNA5P22460 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNA5P22460 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNA5P22460 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNA5P22460 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNA5P22460 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNA5P22460 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNA5P22460 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNA5P22460 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNA5P22460 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNA5P22460 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNA5P22460 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNA5P22460 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNA5P22460 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNA5P22460 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNA5P22460 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNA5P22460 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNA5P22460 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNA5P22460 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNA5P22460 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
KCNA5P22460 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26■■□□□ 1.75
KCNA5P22460 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KCNA5P22460 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KCNA5P22460 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNA5P22460 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNA5P22460 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNA5P22460 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNA5P22460 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNA5P22460 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNA5P22460 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNA5P22460 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNA5P22460 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNA5P22460 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNA5P22460 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNA5P22460 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNA5P22460 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNA5P22460 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNA5P22460 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNA5P22460 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNA5P22460 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNA5P22460 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNA5P22460 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNA5P22460 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNA5P22460 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
KCNA5P22460 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
KCNA5P22460 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNA5P22460 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNA5P22460 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNA5P22460 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNA5P22460 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNA5P22460 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNA5P22460 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNA5P22460 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNA5P22460 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNA5P22460 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNA5P22460 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNA5P22460 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNA5P22460 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNA5P22460 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNA5P22460 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNA5P22460 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNA5P22460 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNA5P22460 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNA5P22460 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNA5P22460 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNA5P22460 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNA5P22460 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNA5P22460 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNA5P22460 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNA5P22460 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNA5P22460 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNA5P22460 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNA5P22460 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNA5P22460 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNA5P22460 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNA5P22460 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNA5P22460 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNA5P22460 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms