Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCP2P22307 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCP2P22307 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCP2P22307 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCP2P22307 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCP2P22307 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCP2P22307 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCP2P22307 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCP2P22307 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCP2P22307 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCP2P22307 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SCP2P22307 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCP2P22307 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCP2P22307 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCP2P22307 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCP2P22307 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCP2P22307 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCP2P22307 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCP2P22307 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCP2P22307 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SCP2P22307 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SCP2P22307 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCP2P22307 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCP2P22307 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SCP2P22307 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SCP2P22307 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCP2P22307 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCP2P22307 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCP2P22307 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCP2P22307 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCP2P22307 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCP2P22307 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCP2P22307 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCP2P22307 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCP2P22307 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCP2P22307 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCP2P22307 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCP2P22307 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCP2P22307 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCP2P22307 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCP2P22307 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCP2P22307 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCP2P22307 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCP2P22307 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCP2P22307 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCP2P22307 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCP2P22307 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCP2P22307 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SCP2P22307 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SCP2P22307 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SCP2P22307 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SCP2P22307 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCP2P22307 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SCP2P22307 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCP2P22307 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCP2P22307 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCP2P22307 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCP2P22307 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SCP2P22307 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCP2P22307 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCP2P22307 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCP2P22307 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCP2P22307 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCP2P22307 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCP2P22307 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCP2P22307 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCP2P22307 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCP2P22307 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCP2P22307 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCP2P22307 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCP2P22307 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCP2P22307 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCP2P22307 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCP2P22307 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCP2P22307 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCP2P22307 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCP2P22307 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCP2P22307 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCP2P22307 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCP2P22307 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCP2P22307 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCP2P22307 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCP2P22307 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCP2P22307 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SCP2P22307 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCP2P22307 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCP2P22307 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCP2P22307 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCP2P22307 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SCP2P22307 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCP2P22307 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SCP2P22307 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCP2P22307 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCP2P22307 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCP2P22307 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCP2P22307 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCP2P22307 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCP2P22307 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCP2P22307 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCP2P22307 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms