Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP4AP20648 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP4AP20648 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP4AP20648 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP4AP20648 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP4AP20648 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP4AP20648 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP4AP20648 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP4AP20648 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP4AP20648 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP4AP20648 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP4AP20648 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP4AP20648 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP4AP20648 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP4AP20648 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP4AP20648 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP4AP20648 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP4AP20648 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP4AP20648 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP4AP20648 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP4AP20648 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP4AP20648 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP4AP20648 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP4AP20648 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP4AP20648 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP4AP20648 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP4AP20648 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP4AP20648 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP4AP20648 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ATP4AP20648 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP4AP20648 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP4AP20648 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP4AP20648 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP4AP20648 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP4AP20648 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP4AP20648 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP4AP20648 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP4AP20648 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP4AP20648 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP4AP20648 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP4AP20648 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP4AP20648 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP4AP20648 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP4AP20648 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP4AP20648 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP4AP20648 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP4AP20648 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP4AP20648 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP4AP20648 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP4AP20648 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP4AP20648 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP4AP20648 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP4AP20648 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP4AP20648 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP4AP20648 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP4AP20648 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP4AP20648 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP4AP20648 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP4AP20648 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP4AP20648 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP4AP20648 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP4AP20648 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP4AP20648 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP4AP20648 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP4AP20648 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ATP4AP20648 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ATP4AP20648 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ATP4AP20648 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP4AP20648 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP4AP20648 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP4AP20648 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP4AP20648 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP4AP20648 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP4AP20648 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP4AP20648 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP4AP20648 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP4AP20648 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP4AP20648 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP4AP20648 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP4AP20648 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP4AP20648 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP4AP20648 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP4AP20648 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP4AP20648 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP4AP20648 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP4AP20648 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP4AP20648 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP4AP20648 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP4AP20648 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP4AP20648 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP4AP20648 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP4AP20648 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP4AP20648 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP4AP20648 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP4AP20648 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP4AP20648 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP4AP20648 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP4AP20648 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP4AP20648 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP4AP20648 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms