Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB5AP20339 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB5AP20339 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB5AP20339 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB5AP20339 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB5AP20339 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB5AP20339 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB5AP20339 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB5AP20339 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB5AP20339 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB5AP20339 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB5AP20339 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB5AP20339 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB5AP20339 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB5AP20339 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB5AP20339 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB5AP20339 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB5AP20339 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB5AP20339 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB5AP20339 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB5AP20339 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB5AP20339 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB5AP20339 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB5AP20339 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB5AP20339 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB5AP20339 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB5AP20339 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB5AP20339 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB5AP20339 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB5AP20339 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB5AP20339 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB5AP20339 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB5AP20339 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB5AP20339 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB5AP20339 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB5AP20339 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB5AP20339 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB5AP20339 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB5AP20339 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB5AP20339 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RAB5AP20339 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB5AP20339 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB5AP20339 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB5AP20339 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB5AP20339 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB5AP20339 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB5AP20339 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB5AP20339 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB5AP20339 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB5AP20339 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB5AP20339 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB5AP20339 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB5AP20339 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB5AP20339 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB5AP20339 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB5AP20339 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB5AP20339 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB5AP20339 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB5AP20339 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB5AP20339 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB5AP20339 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB5AP20339 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB5AP20339 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB5AP20339 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB5AP20339 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB5AP20339 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB5AP20339 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB5AP20339 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB5AP20339 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB5AP20339 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB5AP20339 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB5AP20339 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB5AP20339 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB5AP20339 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB5AP20339 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB5AP20339 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB5AP20339 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB5AP20339 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB5AP20339 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB5AP20339 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB5AP20339 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB5AP20339 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB5AP20339 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB5AP20339 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB5AP20339 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RAB5AP20339 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RAB5AP20339 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RAB5AP20339 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RAB5AP20339 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RAB5AP20339 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RAB5AP20339 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAB5AP20339 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAB5AP20339 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAB5AP20339 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAB5AP20339 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAB5AP20339 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAB5AP20339 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAB5AP20339 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAB5AP20339 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAB5AP20339 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms