Protein–RNA interactions for Protein: P18074

ERCC2, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPD subunit, humanhuman

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC2P18074 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC2P18074 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC2P18074 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC2P18074 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC2P18074 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC2P18074 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC2P18074 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC2P18074 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC2P18074 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC2P18074 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC2P18074 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC2P18074 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERCC2P18074 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERCC2P18074 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ERCC2P18074 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERCC2P18074 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERCC2P18074 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ERCC2P18074 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERCC2P18074 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERCC2P18074 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERCC2P18074 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERCC2P18074 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERCC2P18074 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERCC2P18074 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERCC2P18074 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERCC2P18074 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC2P18074 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC2P18074 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC2P18074 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC2P18074 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC2P18074 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERCC2P18074 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERCC2P18074 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERCC2P18074 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERCC2P18074 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERCC2P18074 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERCC2P18074 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC2P18074 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC2P18074 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC2P18074 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC2P18074 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC2P18074 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC2P18074 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERCC2P18074 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERCC2P18074 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERCC2P18074 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ERCC2P18074 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERCC2P18074 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERCC2P18074 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERCC2P18074 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERCC2P18074 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERCC2P18074 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERCC2P18074 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERCC2P18074 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERCC2P18074 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERCC2P18074 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERCC2P18074 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERCC2P18074 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ERCC2P18074 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERCC2P18074 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ERCC2P18074 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERCC2P18074 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERCC2P18074 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERCC2P18074 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERCC2P18074 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ERCC2P18074 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERCC2P18074 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERCC2P18074 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERCC2P18074 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERCC2P18074 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERCC2P18074 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERCC2P18074 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERCC2P18074 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERCC2P18074 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERCC2P18074 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERCC2P18074 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERCC2P18074 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERCC2P18074 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERCC2P18074 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC2P18074 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC2P18074 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC2P18074 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC2P18074 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC2P18074 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC2P18074 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERCC2P18074 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERCC2P18074 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERCC2P18074 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ERCC2P18074 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ERCC2P18074 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ERCC2P18074 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ERCC2P18074 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ERCC2P18074 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ERCC2P18074 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ERCC2P18074 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ERCC2P18074 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ERCC2P18074 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ERCC2P18074 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERCC2P18074 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERCC2P18074 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms