Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GM2AP17900 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GM2AP17900 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GM2AP17900 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GM2AP17900 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GM2AP17900 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GM2AP17900 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GM2AP17900 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GM2AP17900 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GM2AP17900 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GM2AP17900 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GM2AP17900 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GM2AP17900 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GM2AP17900 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GM2AP17900 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GM2AP17900 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GM2AP17900 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GM2AP17900 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GM2AP17900 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GM2AP17900 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GM2AP17900 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GM2AP17900 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GM2AP17900 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GM2AP17900 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GM2AP17900 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GM2AP17900 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GM2AP17900 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GM2AP17900 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GM2AP17900 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GM2AP17900 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GM2AP17900 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GM2AP17900 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GM2AP17900 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GM2AP17900 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GM2AP17900 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GM2AP17900 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GM2AP17900 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GM2AP17900 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
GM2AP17900 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GM2AP17900 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GM2AP17900 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GM2AP17900 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GM2AP17900 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GM2AP17900 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GM2AP17900 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GM2AP17900 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GM2AP17900 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GM2AP17900 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GM2AP17900 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GM2AP17900 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GM2AP17900 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GM2AP17900 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GM2AP17900 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GM2AP17900 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GM2AP17900 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GM2AP17900 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GM2AP17900 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GM2AP17900 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GM2AP17900 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GM2AP17900 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GM2AP17900 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GM2AP17900 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GM2AP17900 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GM2AP17900 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GM2AP17900 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GM2AP17900 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GM2AP17900 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GM2AP17900 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GM2AP17900 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GM2AP17900 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GM2AP17900 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GM2AP17900 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GM2AP17900 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GM2AP17900 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GM2AP17900 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GM2AP17900 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GM2AP17900 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GM2AP17900 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GM2AP17900 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GM2AP17900 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GM2AP17900 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GM2AP17900 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GM2AP17900 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GM2AP17900 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GM2AP17900 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GM2AP17900 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GM2AP17900 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GM2AP17900 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GM2AP17900 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GM2AP17900 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GM2AP17900 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GM2AP17900 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GM2AP17900 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GM2AP17900 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GM2AP17900 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GM2AP17900 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GM2AP17900 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GM2AP17900 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GM2AP17900 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GM2AP17900 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms