Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJA1P17302 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJA1P17302 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJA1P17302 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJA1P17302 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJA1P17302 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GJA1P17302 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJA1P17302 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
GJA1P17302 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJA1P17302 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJA1P17302 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJA1P17302 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJA1P17302 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJA1P17302 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJA1P17302 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJA1P17302 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJA1P17302 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJA1P17302 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJA1P17302 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJA1P17302 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJA1P17302 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJA1P17302 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJA1P17302 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJA1P17302 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJA1P17302 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJA1P17302 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJA1P17302 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJA1P17302 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJA1P17302 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJA1P17302 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJA1P17302 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJA1P17302 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJA1P17302 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJA1P17302 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GJA1P17302 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJA1P17302 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJA1P17302 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GJA1P17302 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJA1P17302 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJA1P17302 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJA1P17302 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJA1P17302 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJA1P17302 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJA1P17302 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJA1P17302 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJA1P17302 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJA1P17302 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJA1P17302 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJA1P17302 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJA1P17302 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJA1P17302 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJA1P17302 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJA1P17302 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJA1P17302 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJA1P17302 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJA1P17302 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJA1P17302 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJA1P17302 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJA1P17302 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJA1P17302 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJA1P17302 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJA1P17302 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJA1P17302 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GJA1P17302 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJA1P17302 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GJA1P17302 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJA1P17302 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJA1P17302 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJA1P17302 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJA1P17302 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJA1P17302 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJA1P17302 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJA1P17302 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJA1P17302 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJA1P17302 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJA1P17302 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJA1P17302 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJA1P17302 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJA1P17302 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GJA1P17302 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJA1P17302 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJA1P17302 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJA1P17302 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJA1P17302 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJA1P17302 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJA1P17302 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJA1P17302 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJA1P17302 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJA1P17302 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJA1P17302 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJA1P17302 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJA1P17302 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJA1P17302 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJA1P17302 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJA1P17302 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GJA1P17302 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJA1P17302 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJA1P17302 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJA1P17302 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJA1P17302 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms