Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EPCAMP16422 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
EPCAMP16422 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EPCAMP16422 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EPCAMP16422 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EPCAMP16422 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EPCAMP16422 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EPCAMP16422 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EPCAMP16422 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EPCAMP16422 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EPCAMP16422 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EPCAMP16422 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EPCAMP16422 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
EPCAMP16422 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
EPCAMP16422 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
EPCAMP16422 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EPCAMP16422 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EPCAMP16422 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EPCAMP16422 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EPCAMP16422 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EPCAMP16422 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EPCAMP16422 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EPCAMP16422 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EPCAMP16422 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EPCAMP16422 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
EPCAMP16422 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EPCAMP16422 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EPCAMP16422 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EPCAMP16422 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EPCAMP16422 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EPCAMP16422 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EPCAMP16422 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EPCAMP16422 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EPCAMP16422 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
EPCAMP16422 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EPCAMP16422 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EPCAMP16422 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EPCAMP16422 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EPCAMP16422 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
EPCAMP16422 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EPCAMP16422 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EPCAMP16422 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EPCAMP16422 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EPCAMP16422 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EPCAMP16422 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EPCAMP16422 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EPCAMP16422 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EPCAMP16422 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EPCAMP16422 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EPCAMP16422 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EPCAMP16422 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EPCAMP16422 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EPCAMP16422 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EPCAMP16422 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EPCAMP16422 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EPCAMP16422 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EPCAMP16422 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EPCAMP16422 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
EPCAMP16422 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EPCAMP16422 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EPCAMP16422 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EPCAMP16422 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EPCAMP16422 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EPCAMP16422 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EPCAMP16422 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EPCAMP16422 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EPCAMP16422 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EPCAMP16422 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EPCAMP16422 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EPCAMP16422 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EPCAMP16422 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EPCAMP16422 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EPCAMP16422 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EPCAMP16422 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EPCAMP16422 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EPCAMP16422 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EPCAMP16422 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EPCAMP16422 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EPCAMP16422 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EPCAMP16422 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EPCAMP16422 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EPCAMP16422 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EPCAMP16422 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EPCAMP16422 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EPCAMP16422 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EPCAMP16422 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EPCAMP16422 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EPCAMP16422 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EPCAMP16422 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EPCAMP16422 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EPCAMP16422 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EPCAMP16422 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
EPCAMP16422 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
EPCAMP16422 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EPCAMP16422 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EPCAMP16422 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EPCAMP16422 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EPCAMP16422 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EPCAMP16422 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EPCAMP16422 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.6 ms