Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRA1P14867 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRA1P14867 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRA1P14867 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRA1P14867 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRA1P14867 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRA1P14867 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRA1P14867 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRA1P14867 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRA1P14867 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRA1P14867 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRA1P14867 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRA1P14867 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRA1P14867 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRA1P14867 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRA1P14867 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRA1P14867 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRA1P14867 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRA1P14867 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRA1P14867 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRA1P14867 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRA1P14867 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRA1P14867 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GABRA1P14867 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GABRA1P14867 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GABRA1P14867 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRA1P14867 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRA1P14867 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRA1P14867 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRA1P14867 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRA1P14867 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRA1P14867 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRA1P14867 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRA1P14867 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRA1P14867 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRA1P14867 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRA1P14867 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRA1P14867 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRA1P14867 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRA1P14867 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRA1P14867 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRA1P14867 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRA1P14867 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRA1P14867 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRA1P14867 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRA1P14867 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRA1P14867 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRA1P14867 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRA1P14867 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRA1P14867 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRA1P14867 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRA1P14867 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRA1P14867 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRA1P14867 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRA1P14867 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRA1P14867 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRA1P14867 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRA1P14867 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRA1P14867 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRA1P14867 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRA1P14867 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRA1P14867 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRA1P14867 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRA1P14867 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRA1P14867 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRA1P14867 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRA1P14867 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRA1P14867 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRA1P14867 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRA1P14867 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRA1P14867 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRA1P14867 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRA1P14867 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GABRA1P14867 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABRA1P14867 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GABRA1P14867 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABRA1P14867 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRA1P14867 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRA1P14867 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRA1P14867 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRA1P14867 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRA1P14867 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRA1P14867 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRA1P14867 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRA1P14867 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRA1P14867 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRA1P14867 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRA1P14867 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRA1P14867 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRA1P14867 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRA1P14867 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRA1P14867 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRA1P14867 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRA1P14867 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRA1P14867 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRA1P14867 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRA1P14867 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRA1P14867 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRA1P14867 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRA1P14867 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms