Protein–RNA interactions for Protein: P13647

KRT5, Keratin, type II cytoskeletal 5, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT5P13647 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT5P13647 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT5P13647 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT5P13647 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT5P13647 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT5P13647 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT5P13647 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT5P13647 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT5P13647 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT5P13647 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT5P13647 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT5P13647 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT5P13647 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT5P13647 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KRT5P13647 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT5P13647 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT5P13647 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT5P13647 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT5P13647 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT5P13647 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT5P13647 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT5P13647 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT5P13647 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT5P13647 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT5P13647 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT5P13647 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT5P13647 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT5P13647 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT5P13647 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT5P13647 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT5P13647 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT5P13647 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT5P13647 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT5P13647 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT5P13647 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT5P13647 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT5P13647 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT5P13647 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT5P13647 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT5P13647 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT5P13647 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT5P13647 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT5P13647 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT5P13647 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT5P13647 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT5P13647 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT5P13647 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT5P13647 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT5P13647 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT5P13647 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT5P13647 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT5P13647 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT5P13647 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT5P13647 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT5P13647 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT5P13647 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT5P13647 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT5P13647 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT5P13647 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT5P13647 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT5P13647 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT5P13647 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT5P13647 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT5P13647 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT5P13647 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT5P13647 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT5P13647 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT5P13647 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT5P13647 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT5P13647 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT5P13647 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT5P13647 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT5P13647 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT5P13647 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT5P13647 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT5P13647 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT5P13647 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT5P13647 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT5P13647 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT5P13647 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT5P13647 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT5P13647 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT5P13647 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT5P13647 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT5P13647 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT5P13647 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT5P13647 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT5P13647 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT5P13647 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT5P13647 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
KRT5P13647 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26■■□□□ 1.75
KRT5P13647 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT5P13647 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT5P13647 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT5P13647 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT5P13647 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT5P13647 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT5P13647 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT5P13647 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT5P13647 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.4 ms