Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
TOP2AP11388 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
TOP2AP11388 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
TOP2AP11388 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
TOP2AP11388 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
TOP2AP11388 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.63■■■■■ 4.57
TOP2AP11388 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.63■■■■■ 4.57
TOP2AP11388 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC43.62■■■■■ 4.57
TOP2AP11388 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC43.62■■■■■ 4.57
TOP2AP11388 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.62■■■■■ 4.57
TOP2AP11388 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
TOP2AP11388 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC43.61■■■■■ 4.57
TOP2AP11388 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
TOP2AP11388 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
TOP2AP11388 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC43.61■■■■■ 4.57
TOP2AP11388 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC43.6■■■■■ 4.57
TOP2AP11388 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
TOP2AP11388 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
TOP2AP11388 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.59■■■■■ 4.57
TOP2AP11388 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC43.58■■■■■ 4.57
TOP2AP11388 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC43.58■■■■■ 4.57
TOP2AP11388 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
TOP2AP11388 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.56
TOP2AP11388 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
TOP2AP11388 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
TOP2AP11388 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.56■■■■■ 4.56
TOP2AP11388 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
TOP2AP11388 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
TOP2AP11388 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC43.56■■■■■ 4.56
TOP2AP11388 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC43.56■■■■■ 4.56
TOP2AP11388 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
TOP2AP11388 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
TOP2AP11388 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC43.55■■■■■ 4.56
TOP2AP11388 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
TOP2AP11388 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.54■■■■■ 4.56
TOP2AP11388 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC43.53■■■■■ 4.56
TOP2AP11388 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
TOP2AP11388 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43.53■■■■■ 4.56
TOP2AP11388 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC43.53■■■■■ 4.56
TOP2AP11388 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC43.53■■■■■ 4.56
TOP2AP11388 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC43.53■■■■■ 4.56
TOP2AP11388 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC43.52■■■■■ 4.56
TOP2AP11388 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
TOP2AP11388 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
TOP2AP11388 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.52■■■■■ 4.56
TOP2AP11388 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC43.52■■■■■ 4.56
TOP2AP11388 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC43.51■■■■■ 4.56
TOP2AP11388 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
TOP2AP11388 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
TOP2AP11388 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
TOP2AP11388 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC43.5■■■■■ 4.55
TOP2AP11388 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
TOP2AP11388 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC43.49■■■■■ 4.55
TOP2AP11388 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.49■■■■■ 4.55
TOP2AP11388 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC43.48■■■■■ 4.55
TOP2AP11388 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC43.48■■■■■ 4.55
TOP2AP11388 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC43.48■■■■■ 4.55
TOP2AP11388 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC43.47■■■■■ 4.55
TOP2AP11388 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC43.47■■■■■ 4.55
TOP2AP11388 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
TOP2AP11388 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC43.46■■■■■ 4.55
TOP2AP11388 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC43.46■■■■■ 4.55
TOP2AP11388 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
TOP2AP11388 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
TOP2AP11388 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
TOP2AP11388 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.44■■■■■ 4.55
TOP2AP11388 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
TOP2AP11388 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.44■■■■■ 4.54
TOP2AP11388 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC43.44■■■■■ 4.54
TOP2AP11388 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.44■■■■■ 4.54
TOP2AP11388 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
TOP2AP11388 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.43■■■■■ 4.54
TOP2AP11388 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
TOP2AP11388 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC43.41■■■■■ 4.54
TOP2AP11388 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.41■■■■■ 4.54
TOP2AP11388 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
TOP2AP11388 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC43.4■■■■■ 4.54
TOP2AP11388 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43.39■■■■■ 4.54
TOP2AP11388 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
TOP2AP11388 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC43.39■■■■■ 4.54
TOP2AP11388 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC43.39■■■■■ 4.54
TOP2AP11388 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
TOP2AP11388 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.54
TOP2AP11388 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC43.38■■■■■ 4.54
TOP2AP11388 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.53
TOP2AP11388 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
TOP2AP11388 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
TOP2AP11388 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
TOP2AP11388 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
TOP2AP11388 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC43.36■■■■■ 4.53
TOP2AP11388 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
TOP2AP11388 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC43.36■■■■■ 4.53
TOP2AP11388 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
TOP2AP11388 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
TOP2AP11388 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
TOP2AP11388 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
TOP2AP11388 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
TOP2AP11388 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.34■■■■■ 4.53
TOP2AP11388 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
TOP2AP11388 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC43.32■■■■■ 4.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms