Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
LAMC1P11047 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
LAMC1P11047 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
LAMC1P11047 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
LAMC1P11047 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
LAMC1P11047 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC35.03■■■■□ 3.2
LAMC1P11047 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
LAMC1P11047 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
LAMC1P11047 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
LAMC1P11047 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
LAMC1P11047 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
LAMC1P11047 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
LAMC1P11047 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
LAMC1P11047 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
LAMC1P11047 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
LAMC1P11047 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
LAMC1P11047 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
LAMC1P11047 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
LAMC1P11047 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
LAMC1P11047 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
LAMC1P11047 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
LAMC1P11047 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
LAMC1P11047 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
LAMC1P11047 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
LAMC1P11047 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
LAMC1P11047 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
LAMC1P11047 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
LAMC1P11047 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
LAMC1P11047 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
LAMC1P11047 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.18
LAMC1P11047 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.18
LAMC1P11047 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
LAMC1P11047 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
LAMC1P11047 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
LAMC1P11047 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
LAMC1P11047 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
LAMC1P11047 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
LAMC1P11047 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
LAMC1P11047 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
LAMC1P11047 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
LAMC1P11047 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
LAMC1P11047 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
LAMC1P11047 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
LAMC1P11047 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
LAMC1P11047 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
LAMC1P11047 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
LAMC1P11047 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
LAMC1P11047 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
LAMC1P11047 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
LAMC1P11047 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
LAMC1P11047 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
LAMC1P11047 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
LAMC1P11047 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
LAMC1P11047 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
LAMC1P11047 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
LAMC1P11047 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
LAMC1P11047 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
LAMC1P11047 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
LAMC1P11047 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
LAMC1P11047 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
LAMC1P11047 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
LAMC1P11047 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
LAMC1P11047 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
LAMC1P11047 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
LAMC1P11047 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
LAMC1P11047 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
LAMC1P11047 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
LAMC1P11047 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
LAMC1P11047 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
LAMC1P11047 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
LAMC1P11047 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
LAMC1P11047 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
LAMC1P11047 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
LAMC1P11047 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
LAMC1P11047 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
LAMC1P11047 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
LAMC1P11047 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC34.84■■■■□ 3.17
LAMC1P11047 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
LAMC1P11047 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
LAMC1P11047 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
LAMC1P11047 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
LAMC1P11047 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
LAMC1P11047 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
LAMC1P11047 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
LAMC1P11047 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
LAMC1P11047 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
LAMC1P11047 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
LAMC1P11047 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
LAMC1P11047 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
LAMC1P11047 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
LAMC1P11047 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
LAMC1P11047 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
LAMC1P11047 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
LAMC1P11047 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
LAMC1P11047 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
LAMC1P11047 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
LAMC1P11047 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
LAMC1P11047 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
LAMC1P11047 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
LAMC1P11047 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms