Protein–RNA interactions for Protein: P11021

HSPA5, 78 kDa glucose-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA5P11021 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
HSPA5P11021 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
HSPA5P11021 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC34.42■■■■□ 3.1
HSPA5P11021 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
HSPA5P11021 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
HSPA5P11021 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
HSPA5P11021 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
HSPA5P11021 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
HSPA5P11021 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
HSPA5P11021 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
HSPA5P11021 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
HSPA5P11021 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
HSPA5P11021 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
HSPA5P11021 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
HSPA5P11021 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
HSPA5P11021 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
HSPA5P11021 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
HSPA5P11021 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
HSPA5P11021 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
HSPA5P11021 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
HSPA5P11021 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
HSPA5P11021 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
HSPA5P11021 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
HSPA5P11021 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
HSPA5P11021 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
HSPA5P11021 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
HSPA5P11021 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC34.35■■■■□ 3.09
HSPA5P11021 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
HSPA5P11021 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
HSPA5P11021 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
HSPA5P11021 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
HSPA5P11021 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
HSPA5P11021 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC34.34■■■■□ 3.09
HSPA5P11021 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
HSPA5P11021 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
HSPA5P11021 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
HSPA5P11021 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
HSPA5P11021 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
HSPA5P11021 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
HSPA5P11021 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
HSPA5P11021 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
HSPA5P11021 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
HSPA5P11021 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
HSPA5P11021 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
HSPA5P11021 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
HSPA5P11021 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
HSPA5P11021 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
HSPA5P11021 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
HSPA5P11021 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
HSPA5P11021 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
HSPA5P11021 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
HSPA5P11021 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
HSPA5P11021 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
HSPA5P11021 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
HSPA5P11021 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
HSPA5P11021 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
HSPA5P11021 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
HSPA5P11021 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
HSPA5P11021 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
HSPA5P11021 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
HSPA5P11021 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
HSPA5P11021 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
HSPA5P11021 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
HSPA5P11021 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
HSPA5P11021 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
HSPA5P11021 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
HSPA5P11021 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
HSPA5P11021 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
HSPA5P11021 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
HSPA5P11021 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
HSPA5P11021 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
HSPA5P11021 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
HSPA5P11021 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
HSPA5P11021 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
HSPA5P11021 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
HSPA5P11021 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
HSPA5P11021 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
HSPA5P11021 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
HSPA5P11021 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
HSPA5P11021 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
HSPA5P11021 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
HSPA5P11021 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
HSPA5P11021 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
HSPA5P11021 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
HSPA5P11021 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
HSPA5P11021 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
HSPA5P11021 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
HSPA5P11021 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
HSPA5P11021 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
HSPA5P11021 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
HSPA5P11021 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
HSPA5P11021 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
HSPA5P11021 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
HSPA5P11021 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
HSPA5P11021 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
HSPA5P11021 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
HSPA5P11021 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
HSPA5P11021 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
HSPA5P11021 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
HSPA5P11021 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms