Protein–RNA interactions for Protein: P10144

GZMB, Granzyme B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GZMBP10144 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GZMBP10144 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GZMBP10144 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GZMBP10144 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GZMBP10144 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GZMBP10144 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GZMBP10144 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GZMBP10144 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GZMBP10144 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GZMBP10144 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GZMBP10144 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GZMBP10144 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GZMBP10144 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GZMBP10144 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GZMBP10144 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GZMBP10144 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GZMBP10144 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GZMBP10144 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GZMBP10144 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GZMBP10144 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GZMBP10144 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GZMBP10144 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GZMBP10144 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GZMBP10144 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GZMBP10144 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GZMBP10144 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GZMBP10144 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GZMBP10144 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GZMBP10144 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GZMBP10144 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GZMBP10144 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GZMBP10144 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GZMBP10144 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GZMBP10144 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GZMBP10144 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GZMBP10144 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GZMBP10144 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GZMBP10144 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GZMBP10144 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GZMBP10144 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GZMBP10144 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GZMBP10144 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GZMBP10144 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GZMBP10144 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GZMBP10144 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GZMBP10144 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GZMBP10144 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GZMBP10144 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GZMBP10144 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GZMBP10144 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GZMBP10144 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GZMBP10144 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GZMBP10144 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GZMBP10144 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GZMBP10144 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GZMBP10144 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GZMBP10144 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GZMBP10144 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GZMBP10144 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GZMBP10144 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GZMBP10144 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GZMBP10144 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GZMBP10144 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GZMBP10144 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GZMBP10144 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GZMBP10144 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GZMBP10144 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GZMBP10144 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GZMBP10144 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GZMBP10144 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GZMBP10144 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GZMBP10144 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GZMBP10144 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GZMBP10144 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GZMBP10144 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GZMBP10144 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GZMBP10144 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GZMBP10144 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GZMBP10144 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GZMBP10144 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GZMBP10144 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GZMBP10144 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GZMBP10144 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GZMBP10144 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GZMBP10144 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GZMBP10144 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GZMBP10144 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GZMBP10144 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GZMBP10144 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GZMBP10144 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GZMBP10144 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GZMBP10144 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GZMBP10144 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GZMBP10144 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GZMBP10144 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GZMBP10144 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GZMBP10144 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GZMBP10144 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GZMBP10144 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GZMBP10144 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms