Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HKR1P10072 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HKR1P10072 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HKR1P10072 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HKR1P10072 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HKR1P10072 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HKR1P10072 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HKR1P10072 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HKR1P10072 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HKR1P10072 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HKR1P10072 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HKR1P10072 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HKR1P10072 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HKR1P10072 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HKR1P10072 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HKR1P10072 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HKR1P10072 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HKR1P10072 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HKR1P10072 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HKR1P10072 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HKR1P10072 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HKR1P10072 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HKR1P10072 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HKR1P10072 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HKR1P10072 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HKR1P10072 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HKR1P10072 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HKR1P10072 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HKR1P10072 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HKR1P10072 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HKR1P10072 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HKR1P10072 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HKR1P10072 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HKR1P10072 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HKR1P10072 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HKR1P10072 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HKR1P10072 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HKR1P10072 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HKR1P10072 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HKR1P10072 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HKR1P10072 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HKR1P10072 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HKR1P10072 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HKR1P10072 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HKR1P10072 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HKR1P10072 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HKR1P10072 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HKR1P10072 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HKR1P10072 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HKR1P10072 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HKR1P10072 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HKR1P10072 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HKR1P10072 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HKR1P10072 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HKR1P10072 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HKR1P10072 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HKR1P10072 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HKR1P10072 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HKR1P10072 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HKR1P10072 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HKR1P10072 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HKR1P10072 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HKR1P10072 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HKR1P10072 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HKR1P10072 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HKR1P10072 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HKR1P10072 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HKR1P10072 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HKR1P10072 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HKR1P10072 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HKR1P10072 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HKR1P10072 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HKR1P10072 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HKR1P10072 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HKR1P10072 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HKR1P10072 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HKR1P10072 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HKR1P10072 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HKR1P10072 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HKR1P10072 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HKR1P10072 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HKR1P10072 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HKR1P10072 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HKR1P10072 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HKR1P10072 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HKR1P10072 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HKR1P10072 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
HKR1P10072 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
HKR1P10072 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HKR1P10072 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HKR1P10072 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HKR1P10072 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HKR1P10072 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HKR1P10072 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HKR1P10072 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HKR1P10072 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HKR1P10072 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HKR1P10072 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HKR1P10072 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HKR1P10072 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms