Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W0

PRR29, Proline-rich protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR29P0C7W0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRR29P0C7W0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRR29P0C7W0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRR29P0C7W0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRR29P0C7W0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRR29P0C7W0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PRR29P0C7W0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PRR29P0C7W0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRR29P0C7W0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PRR29P0C7W0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRR29P0C7W0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRR29P0C7W0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRR29P0C7W0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRR29P0C7W0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRR29P0C7W0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRR29P0C7W0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRR29P0C7W0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRR29P0C7W0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRR29P0C7W0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRR29P0C7W0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRR29P0C7W0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRR29P0C7W0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRR29P0C7W0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRR29P0C7W0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRR29P0C7W0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRR29P0C7W0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRR29P0C7W0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PRR29P0C7W0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PRR29P0C7W0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRR29P0C7W0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PRR29P0C7W0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRR29P0C7W0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRR29P0C7W0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRR29P0C7W0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRR29P0C7W0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRR29P0C7W0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRR29P0C7W0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRR29P0C7W0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRR29P0C7W0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRR29P0C7W0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRR29P0C7W0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRR29P0C7W0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRR29P0C7W0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRR29P0C7W0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRR29P0C7W0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRR29P0C7W0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRR29P0C7W0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRR29P0C7W0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRR29P0C7W0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRR29P0C7W0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRR29P0C7W0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRR29P0C7W0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRR29P0C7W0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRR29P0C7W0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRR29P0C7W0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRR29P0C7W0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
PRR29P0C7W0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PRR29P0C7W0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PRR29P0C7W0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRR29P0C7W0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRR29P0C7W0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRR29P0C7W0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRR29P0C7W0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRR29P0C7W0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRR29P0C7W0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRR29P0C7W0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRR29P0C7W0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRR29P0C7W0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRR29P0C7W0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRR29P0C7W0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRR29P0C7W0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRR29P0C7W0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRR29P0C7W0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRR29P0C7W0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRR29P0C7W0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRR29P0C7W0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRR29P0C7W0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRR29P0C7W0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRR29P0C7W0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRR29P0C7W0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRR29P0C7W0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRR29P0C7W0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRR29P0C7W0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRR29P0C7W0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRR29P0C7W0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRR29P0C7W0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRR29P0C7W0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRR29P0C7W0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PRR29P0C7W0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRR29P0C7W0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRR29P0C7W0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRR29P0C7W0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRR29P0C7W0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRR29P0C7W0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRR29P0C7W0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRR29P0C7W0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRR29P0C7W0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRR29P0C7W0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRR29P0C7W0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRR29P0C7W0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms