Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
C4BP0C0L5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
C4BP0C0L5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
C4BP0C0L5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
C4BP0C0L5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
C4BP0C0L5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
C4BP0C0L5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
C4BP0C0L5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
C4BP0C0L5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
C4BP0C0L5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
C4BP0C0L5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
C4BP0C0L5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
C4BP0C0L5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC31.5■■■□□ 2.63
C4BP0C0L5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC31.5■■■□□ 2.63
C4BP0C0L5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
C4BP0C0L5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
C4BP0C0L5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
C4BP0C0L5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
C4BP0C0L5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
C4BP0C0L5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
C4BP0C0L5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC31.47■■■□□ 2.63
C4BP0C0L5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
C4BP0C0L5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
C4BP0C0L5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
C4BP0C0L5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
C4BP0C0L5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
C4BP0C0L5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
C4BP0C0L5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
C4BP0C0L5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
C4BP0C0L5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC31.45■■■□□ 2.62
C4BP0C0L5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31.44■■■□□ 2.62
C4BP0C0L5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31.44■■■□□ 2.62
C4BP0C0L5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
C4BP0C0L5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
C4BP0C0L5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
C4BP0C0L5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
C4BP0C0L5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
C4BP0C0L5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
C4BP0C0L5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
C4BP0C0L5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
C4BP0C0L5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
C4BP0C0L5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
C4BP0C0L5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
C4BP0C0L5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
C4BP0C0L5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
C4BP0C0L5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
C4BP0C0L5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
C4BP0C0L5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
C4BP0C0L5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
C4BP0C0L5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
C4BP0C0L5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
C4BP0C0L5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
C4BP0C0L5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
C4BP0C0L5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
C4BP0C0L5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
C4BP0C0L5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
C4BP0C0L5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
C4BP0C0L5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
C4BP0C0L5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
C4BP0C0L5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
C4BP0C0L5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
C4BP0C0L5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
C4BP0C0L5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.61
C4BP0C0L5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC31.39■■■□□ 2.61
C4BP0C0L5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
C4BP0C0L5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
C4BP0C0L5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
C4BP0C0L5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
C4BP0C0L5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
C4BP0C0L5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
C4BP0C0L5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
C4BP0C0L5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
C4BP0C0L5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
C4BP0C0L5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
C4BP0C0L5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
C4BP0C0L5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
C4BP0C0L5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
C4BP0C0L5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
C4BP0C0L5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
C4BP0C0L5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
C4BP0C0L5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
C4BP0C0L5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
C4BP0C0L5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
C4BP0C0L5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
C4BP0C0L5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
C4BP0C0L5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
C4BP0C0L5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
C4BP0C0L5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
C4BP0C0L5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
C4BP0C0L5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
C4BP0C0L5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
C4BP0C0L5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
C4BP0C0L5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
C4BP0C0L5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
C4BP0C0L5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
C4BP0C0L5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
C4BP0C0L5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
C4BP0C0L5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
C4BP0C0L5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.61
C4BP0C0L5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.61
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