Protein–RNA interactions for Protein: P07948

LYN, Tyrosine-protein kinase Lyn, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNP07948 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LYNP07948 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LYNP07948 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LYNP07948 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LYNP07948 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LYNP07948 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LYNP07948 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LYNP07948 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LYNP07948 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LYNP07948 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LYNP07948 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LYNP07948 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LYNP07948 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LYNP07948 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LYNP07948 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LYNP07948 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LYNP07948 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LYNP07948 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LYNP07948 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LYNP07948 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LYNP07948 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LYNP07948 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LYNP07948 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LYNP07948 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LYNP07948 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LYNP07948 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LYNP07948 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LYNP07948 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LYNP07948 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LYNP07948 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LYNP07948 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LYNP07948 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LYNP07948 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LYNP07948 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LYNP07948 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LYNP07948 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LYNP07948 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LYNP07948 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LYNP07948 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LYNP07948 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LYNP07948 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LYNP07948 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LYNP07948 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LYNP07948 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LYNP07948 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LYNP07948 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LYNP07948 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LYNP07948 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LYNP07948 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LYNP07948 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LYNP07948 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LYNP07948 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LYNP07948 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LYNP07948 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LYNP07948 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LYNP07948 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LYNP07948 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LYNP07948 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LYNP07948 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LYNP07948 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LYNP07948 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LYNP07948 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LYNP07948 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LYNP07948 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LYNP07948 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LYNP07948 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LYNP07948 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LYNP07948 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LYNP07948 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LYNP07948 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LYNP07948 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LYNP07948 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LYNP07948 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LYNP07948 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LYNP07948 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LYNP07948 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LYNP07948 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LYNP07948 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYNP07948 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYNP07948 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYNP07948 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYNP07948 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYNP07948 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYNP07948 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LYNP07948 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LYNP07948 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LYNP07948 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LYNP07948 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LYNP07948 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LYNP07948 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LYNP07948 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LYNP07948 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LYNP07948 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LYNP07948 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LYNP07948 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LYNP07948 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LYNP07948 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LYNP07948 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LYNP07948 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LYNP07948 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms