Protein–RNA interactions for Protein: P07437

TUBB, Tubulin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBBP07437 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBBP07437 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBBP07437 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBBP07437 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBBP07437 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBBP07437 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBBP07437 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TUBBP07437 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TUBBP07437 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
TUBBP07437 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TUBBP07437 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TUBBP07437 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TUBBP07437 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TUBBP07437 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TUBBP07437 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TUBBP07437 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TUBBP07437 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TUBBP07437 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBBP07437 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBBP07437 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBBP07437 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBBP07437 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBBP07437 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBBP07437 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBBP07437 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBBP07437 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBBP07437 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBBP07437 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TUBBP07437 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TUBBP07437 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TUBBP07437 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TUBBP07437 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TUBBP07437 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TUBBP07437 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TUBBP07437 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBBP07437 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBBP07437 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBBP07437 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBBP07437 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBBP07437 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBBP07437 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBBP07437 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBBP07437 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBBP07437 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBBP07437 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TUBBP07437 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TUBBP07437 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TUBBP07437 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBBP07437 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBBP07437 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBBP07437 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBBP07437 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBBP07437 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBBP07437 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBBP07437 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBBP07437 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBBP07437 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBBP07437 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBBP07437 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBBP07437 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBBP07437 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBBP07437 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBBP07437 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBBP07437 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBBP07437 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBBP07437 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBBP07437 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBBP07437 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBBP07437 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBBP07437 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBBP07437 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBBP07437 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBBP07437 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBBP07437 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBBP07437 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBBP07437 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBBP07437 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBBP07437 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBBP07437 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBBP07437 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBBP07437 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBBP07437 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBBP07437 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBBP07437 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBBP07437 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBBP07437 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBBP07437 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBBP07437 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBBP07437 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBBP07437 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBBP07437 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBBP07437 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBBP07437 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBBP07437 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBBP07437 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBBP07437 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBBP07437 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBBP07437 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBBP07437 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBBP07437 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms