Protein–RNA interactions for Protein: P07359

GP1BA, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BAP07359 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GP1BAP07359 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GP1BAP07359 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GP1BAP07359 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GP1BAP07359 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GP1BAP07359 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GP1BAP07359 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GP1BAP07359 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GP1BAP07359 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GP1BAP07359 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GP1BAP07359 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GP1BAP07359 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GP1BAP07359 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GP1BAP07359 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GP1BAP07359 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GP1BAP07359 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GP1BAP07359 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GP1BAP07359 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GP1BAP07359 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GP1BAP07359 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GP1BAP07359 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GP1BAP07359 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GP1BAP07359 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GP1BAP07359 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GP1BAP07359 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GP1BAP07359 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GP1BAP07359 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GP1BAP07359 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GP1BAP07359 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GP1BAP07359 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GP1BAP07359 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GP1BAP07359 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GP1BAP07359 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GP1BAP07359 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GP1BAP07359 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GP1BAP07359 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GP1BAP07359 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GP1BAP07359 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GP1BAP07359 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GP1BAP07359 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GP1BAP07359 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GP1BAP07359 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GP1BAP07359 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GP1BAP07359 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GP1BAP07359 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GP1BAP07359 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GP1BAP07359 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GP1BAP07359 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GP1BAP07359 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GP1BAP07359 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GP1BAP07359 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GP1BAP07359 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GP1BAP07359 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GP1BAP07359 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GP1BAP07359 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GP1BAP07359 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GP1BAP07359 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GP1BAP07359 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GP1BAP07359 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GP1BAP07359 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GP1BAP07359 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GP1BAP07359 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GP1BAP07359 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GP1BAP07359 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GP1BAP07359 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GP1BAP07359 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GP1BAP07359 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GP1BAP07359 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GP1BAP07359 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GP1BAP07359 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GP1BAP07359 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GP1BAP07359 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GP1BAP07359 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GP1BAP07359 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GP1BAP07359 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GP1BAP07359 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GP1BAP07359 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GP1BAP07359 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GP1BAP07359 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GP1BAP07359 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GP1BAP07359 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GP1BAP07359 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GP1BAP07359 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GP1BAP07359 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GP1BAP07359 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GP1BAP07359 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GP1BAP07359 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GP1BAP07359 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GP1BAP07359 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GP1BAP07359 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GP1BAP07359 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GP1BAP07359 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GP1BAP07359 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GP1BAP07359 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GP1BAP07359 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GP1BAP07359 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GP1BAP07359 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GP1BAP07359 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GP1BAP07359 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GP1BAP07359 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms