Protein–RNA interactions for Protein: P06331

IGHV4-34, Immunoglobulin heavy variable 4-34, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV4-34P06331 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IGHV4-34P06331 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IGHV4-34P06331 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IGHV4-34P06331 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IGHV4-34P06331 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
IGHV4-34P06331 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IGHV4-34P06331 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGHV4-34P06331 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGHV4-34P06331 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGHV4-34P06331 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGHV4-34P06331 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
IGHV4-34P06331 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGHV4-34P06331 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGHV4-34P06331 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGHV4-34P06331 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGHV4-34P06331 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IGHV4-34P06331 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
IGHV4-34P06331 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IGHV4-34P06331 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IGHV4-34P06331 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IGHV4-34P06331 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IGHV4-34P06331 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IGHV4-34P06331 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IGHV4-34P06331 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IGHV4-34P06331 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGHV4-34P06331 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGHV4-34P06331 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGHV4-34P06331 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGHV4-34P06331 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGHV4-34P06331 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IGHV4-34P06331 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IGHV4-34P06331 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
IGHV4-34P06331 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IGHV4-34P06331 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IGHV4-34P06331 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IGHV4-34P06331 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IGHV4-34P06331 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IGHV4-34P06331 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IGHV4-34P06331 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IGHV4-34P06331 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IGHV4-34P06331 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IGHV4-34P06331 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IGHV4-34P06331 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IGHV4-34P06331 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IGHV4-34P06331 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IGHV4-34P06331 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IGHV4-34P06331 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IGHV4-34P06331 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
IGHV4-34P06331 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IGHV4-34P06331 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IGHV4-34P06331 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IGHV4-34P06331 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IGHV4-34P06331 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IGHV4-34P06331 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IGHV4-34P06331 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IGHV4-34P06331 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IGHV4-34P06331 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IGHV4-34P06331 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IGHV4-34P06331 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IGHV4-34P06331 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
IGHV4-34P06331 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
IGHV4-34P06331 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IGHV4-34P06331 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGHV4-34P06331 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGHV4-34P06331 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGHV4-34P06331 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGHV4-34P06331 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IGHV4-34P06331 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IGHV4-34P06331 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
IGHV4-34P06331 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IGHV4-34P06331 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IGHV4-34P06331 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IGHV4-34P06331 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGHV4-34P06331 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGHV4-34P06331 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGHV4-34P06331 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGHV4-34P06331 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGHV4-34P06331 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGHV4-34P06331 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGHV4-34P06331 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGHV4-34P06331 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGHV4-34P06331 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGHV4-34P06331 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGHV4-34P06331 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGHV4-34P06331 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGHV4-34P06331 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IGHV4-34P06331 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IGHV4-34P06331 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGHV4-34P06331 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGHV4-34P06331 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGHV4-34P06331 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGHV4-34P06331 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
IGHV4-34P06331 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGHV4-34P06331 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGHV4-34P06331 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGHV4-34P06331 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGHV4-34P06331 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGHV4-34P06331 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGHV4-34P06331 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGHV4-34P06331 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.1 ms