Protein–RNA interactions for Protein: P04350

TUBB4A, Tubulin beta-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4AP04350 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TUBB4AP04350 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TUBB4AP04350 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TUBB4AP04350 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TUBB4AP04350 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TUBB4AP04350 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TUBB4AP04350 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TUBB4AP04350 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TUBB4AP04350 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TUBB4AP04350 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TUBB4AP04350 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TUBB4AP04350 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TUBB4AP04350 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TUBB4AP04350 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TUBB4AP04350 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TUBB4AP04350 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TUBB4AP04350 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TUBB4AP04350 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TUBB4AP04350 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TUBB4AP04350 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TUBB4AP04350 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TUBB4AP04350 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TUBB4AP04350 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TUBB4AP04350 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TUBB4AP04350 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TUBB4AP04350 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TUBB4AP04350 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TUBB4AP04350 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TUBB4AP04350 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TUBB4AP04350 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TUBB4AP04350 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TUBB4AP04350 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TUBB4AP04350 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUBB4AP04350 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUBB4AP04350 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUBB4AP04350 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUBB4AP04350 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUBB4AP04350 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUBB4AP04350 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUBB4AP04350 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUBB4AP04350 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUBB4AP04350 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUBB4AP04350 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUBB4AP04350 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUBB4AP04350 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUBB4AP04350 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUBB4AP04350 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUBB4AP04350 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUBB4AP04350 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUBB4AP04350 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBB4AP04350 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBB4AP04350 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBB4AP04350 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBB4AP04350 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBB4AP04350 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBB4AP04350 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBB4AP04350 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBB4AP04350 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
TUBB4AP04350 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TUBB4AP04350 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TUBB4AP04350 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TUBB4AP04350 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TUBB4AP04350 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TUBB4AP04350 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TUBB4AP04350 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TUBB4AP04350 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TUBB4AP04350 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TUBB4AP04350 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TUBB4AP04350 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TUBB4AP04350 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TUBB4AP04350 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TUBB4AP04350 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TUBB4AP04350 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TUBB4AP04350 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TUBB4AP04350 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TUBB4AP04350 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TUBB4AP04350 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TUBB4AP04350 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TUBB4AP04350 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBB4AP04350 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBB4AP04350 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBB4AP04350 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBB4AP04350 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBB4AP04350 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBB4AP04350 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBB4AP04350 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBB4AP04350 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBB4AP04350 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TUBB4AP04350 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TUBB4AP04350 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TUBB4AP04350 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TUBB4AP04350 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TUBB4AP04350 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TUBB4AP04350 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TUBB4AP04350 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TUBB4AP04350 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TUBB4AP04350 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TUBB4AP04350 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TUBB4AP04350 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TUBB4AP04350 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms