Protein–RNA interactions for Protein: P02778

CXCL10, C-X-C motif chemokine 10, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL10P02778 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CXCL10P02778 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CXCL10P02778 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CXCL10P02778 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CXCL10P02778 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CXCL10P02778 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CXCL10P02778 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CXCL10P02778 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CXCL10P02778 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CXCL10P02778 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CXCL10P02778 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CXCL10P02778 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CXCL10P02778 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CXCL10P02778 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CXCL10P02778 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CXCL10P02778 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CXCL10P02778 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CXCL10P02778 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CXCL10P02778 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CXCL10P02778 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CXCL10P02778 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CXCL10P02778 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CXCL10P02778 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CXCL10P02778 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CXCL10P02778 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CXCL10P02778 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CXCL10P02778 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CXCL10P02778 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CXCL10P02778 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CXCL10P02778 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CXCL10P02778 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CXCL10P02778 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CXCL10P02778 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CXCL10P02778 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CXCL10P02778 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CXCL10P02778 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CXCL10P02778 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CXCL10P02778 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CXCL10P02778 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CXCL10P02778 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CXCL10P02778 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CXCL10P02778 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CXCL10P02778 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CXCL10P02778 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CXCL10P02778 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CXCL10P02778 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CXCL10P02778 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CXCL10P02778 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CXCL10P02778 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CXCL10P02778 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CXCL10P02778 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CXCL10P02778 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CXCL10P02778 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CXCL10P02778 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CXCL10P02778 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CXCL10P02778 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CXCL10P02778 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CXCL10P02778 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CXCL10P02778 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CXCL10P02778 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CXCL10P02778 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CXCL10P02778 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CXCL10P02778 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CXCL10P02778 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CXCL10P02778 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CXCL10P02778 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CXCL10P02778 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CXCL10P02778 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CXCL10P02778 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CXCL10P02778 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CXCL10P02778 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CXCL10P02778 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CXCL10P02778 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CXCL10P02778 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CXCL10P02778 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CXCL10P02778 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CXCL10P02778 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CXCL10P02778 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CXCL10P02778 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CXCL10P02778 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CXCL10P02778 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CXCL10P02778 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CXCL10P02778 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CXCL10P02778 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CXCL10P02778 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CXCL10P02778 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CXCL10P02778 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CXCL10P02778 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CXCL10P02778 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CXCL10P02778 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CXCL10P02778 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CXCL10P02778 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CXCL10P02778 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CXCL10P02778 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CXCL10P02778 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CXCL10P02778 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CXCL10P02778 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CXCL10P02778 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CXCL10P02778 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CXCL10P02778 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94 ms