Protein–RNA interactions for Protein: P01033

TIMP1, Metalloproteinase inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP1P01033 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TIMP1P01033 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TIMP1P01033 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TIMP1P01033 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TIMP1P01033 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TIMP1P01033 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TIMP1P01033 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TIMP1P01033 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TIMP1P01033 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TIMP1P01033 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TIMP1P01033 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TIMP1P01033 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TIMP1P01033 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TIMP1P01033 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TIMP1P01033 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TIMP1P01033 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TIMP1P01033 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TIMP1P01033 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TIMP1P01033 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TIMP1P01033 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TIMP1P01033 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TIMP1P01033 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TIMP1P01033 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TIMP1P01033 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TIMP1P01033 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TIMP1P01033 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TIMP1P01033 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TIMP1P01033 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TIMP1P01033 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TIMP1P01033 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TIMP1P01033 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TIMP1P01033 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TIMP1P01033 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TIMP1P01033 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TIMP1P01033 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TIMP1P01033 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TIMP1P01033 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TIMP1P01033 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TIMP1P01033 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TIMP1P01033 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TIMP1P01033 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TIMP1P01033 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TIMP1P01033 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TIMP1P01033 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TIMP1P01033 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TIMP1P01033 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TIMP1P01033 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TIMP1P01033 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TIMP1P01033 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TIMP1P01033 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TIMP1P01033 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TIMP1P01033 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TIMP1P01033 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TIMP1P01033 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TIMP1P01033 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TIMP1P01033 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TIMP1P01033 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TIMP1P01033 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TIMP1P01033 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TIMP1P01033 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TIMP1P01033 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TIMP1P01033 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TIMP1P01033 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TIMP1P01033 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TIMP1P01033 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TIMP1P01033 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TIMP1P01033 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TIMP1P01033 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TIMP1P01033 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TIMP1P01033 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TIMP1P01033 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TIMP1P01033 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TIMP1P01033 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TIMP1P01033 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TIMP1P01033 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TIMP1P01033 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TIMP1P01033 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TIMP1P01033 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TIMP1P01033 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TIMP1P01033 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TIMP1P01033 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TIMP1P01033 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TIMP1P01033 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TIMP1P01033 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TIMP1P01033 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TIMP1P01033 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TIMP1P01033 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TIMP1P01033 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TIMP1P01033 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TIMP1P01033 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TIMP1P01033 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TIMP1P01033 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TIMP1P01033 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TIMP1P01033 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TIMP1P01033 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TIMP1P01033 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TIMP1P01033 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TIMP1P01033 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TIMP1P01033 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TIMP1P01033 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms