Protein–RNA interactions for Protein: P00736

C1R, Complement C1r subcomponent, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1RP00736 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
C1RP00736 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
C1RP00736 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
C1RP00736 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C1RP00736 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
C1RP00736 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C1RP00736 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
C1RP00736 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C1RP00736 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
C1RP00736 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
C1RP00736 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
C1RP00736 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
C1RP00736 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
C1RP00736 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C1RP00736 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C1RP00736 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
C1RP00736 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
C1RP00736 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
C1RP00736 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C1RP00736 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C1RP00736 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
C1RP00736 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
C1RP00736 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
C1RP00736 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C1RP00736 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C1RP00736 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C1RP00736 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C1RP00736 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C1RP00736 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
C1RP00736 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C1RP00736 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
C1RP00736 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
C1RP00736 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C1RP00736 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C1RP00736 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C1RP00736 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C1RP00736 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C1RP00736 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C1RP00736 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
C1RP00736 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
C1RP00736 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C1RP00736 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
C1RP00736 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
C1RP00736 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C1RP00736 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C1RP00736 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
C1RP00736 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
C1RP00736 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C1RP00736 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
C1RP00736 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C1RP00736 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C1RP00736 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
C1RP00736 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C1RP00736 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C1RP00736 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C1RP00736 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C1RP00736 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C1RP00736 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C1RP00736 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C1RP00736 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C1RP00736 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C1RP00736 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C1RP00736 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C1RP00736 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
C1RP00736 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
C1RP00736 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
C1RP00736 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C1RP00736 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C1RP00736 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
C1RP00736 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C1RP00736 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C1RP00736 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C1RP00736 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
C1RP00736 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C1RP00736 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C1RP00736 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
C1RP00736 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
C1RP00736 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
C1RP00736 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
C1RP00736 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
C1RP00736 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C1RP00736 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C1RP00736 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C1RP00736 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C1RP00736 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C1RP00736 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
C1RP00736 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C1RP00736 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C1RP00736 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C1RP00736 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C1RP00736 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C1RP00736 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C1RP00736 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
C1RP00736 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C1RP00736 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C1RP00736 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C1RP00736 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
C1RP00736 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
C1RP00736 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
C1RP00736 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms