Protein–RNA interactions for Protein: O95390

GDF11, Growth/differentiation factor 11, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF11O95390 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GDF11O95390 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GDF11O95390 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GDF11O95390 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GDF11O95390 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GDF11O95390 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GDF11O95390 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
GDF11O95390 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GDF11O95390 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GDF11O95390 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GDF11O95390 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GDF11O95390 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GDF11O95390 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GDF11O95390 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GDF11O95390 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GDF11O95390 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GDF11O95390 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
GDF11O95390 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GDF11O95390 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GDF11O95390 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GDF11O95390 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GDF11O95390 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GDF11O95390 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GDF11O95390 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GDF11O95390 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GDF11O95390 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GDF11O95390 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GDF11O95390 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GDF11O95390 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GDF11O95390 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GDF11O95390 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GDF11O95390 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GDF11O95390 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GDF11O95390 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GDF11O95390 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GDF11O95390 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GDF11O95390 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GDF11O95390 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GDF11O95390 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GDF11O95390 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GDF11O95390 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GDF11O95390 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GDF11O95390 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GDF11O95390 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GDF11O95390 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GDF11O95390 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GDF11O95390 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
GDF11O95390 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GDF11O95390 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GDF11O95390 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GDF11O95390 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GDF11O95390 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GDF11O95390 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GDF11O95390 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GDF11O95390 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GDF11O95390 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
GDF11O95390 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GDF11O95390 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GDF11O95390 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GDF11O95390 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GDF11O95390 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GDF11O95390 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GDF11O95390 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GDF11O95390 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GDF11O95390 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GDF11O95390 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GDF11O95390 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GDF11O95390 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GDF11O95390 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GDF11O95390 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GDF11O95390 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GDF11O95390 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GDF11O95390 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GDF11O95390 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GDF11O95390 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GDF11O95390 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GDF11O95390 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GDF11O95390 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GDF11O95390 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
GDF11O95390 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GDF11O95390 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GDF11O95390 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GDF11O95390 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GDF11O95390 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GDF11O95390 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GDF11O95390 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GDF11O95390 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GDF11O95390 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GDF11O95390 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
GDF11O95390 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GDF11O95390 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GDF11O95390 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GDF11O95390 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GDF11O95390 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GDF11O95390 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GDF11O95390 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
GDF11O95390 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GDF11O95390 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GDF11O95390 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GDF11O95390 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms