Protein–RNA interactions for Protein: O95260

ATE1, Arginyl-tRNA--protein transferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATE1O95260 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATE1O95260 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATE1O95260 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATE1O95260 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATE1O95260 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATE1O95260 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATE1O95260 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATE1O95260 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATE1O95260 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATE1O95260 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATE1O95260 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATE1O95260 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATE1O95260 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATE1O95260 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATE1O95260 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATE1O95260 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATE1O95260 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATE1O95260 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATE1O95260 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATE1O95260 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATE1O95260 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATE1O95260 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATE1O95260 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATE1O95260 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATE1O95260 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATE1O95260 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATE1O95260 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATE1O95260 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATE1O95260 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATE1O95260 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATE1O95260 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATE1O95260 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATE1O95260 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATE1O95260 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATE1O95260 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATE1O95260 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATE1O95260 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATE1O95260 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATE1O95260 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATE1O95260 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATE1O95260 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATE1O95260 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATE1O95260 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATE1O95260 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATE1O95260 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATE1O95260 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATE1O95260 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATE1O95260 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATE1O95260 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATE1O95260 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATE1O95260 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATE1O95260 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATE1O95260 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATE1O95260 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATE1O95260 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATE1O95260 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATE1O95260 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATE1O95260 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATE1O95260 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATE1O95260 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATE1O95260 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATE1O95260 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATE1O95260 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ATE1O95260 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATE1O95260 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATE1O95260 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATE1O95260 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATE1O95260 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATE1O95260 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATE1O95260 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATE1O95260 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATE1O95260 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATE1O95260 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATE1O95260 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATE1O95260 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATE1O95260 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATE1O95260 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATE1O95260 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATE1O95260 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATE1O95260 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATE1O95260 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATE1O95260 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATE1O95260 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATE1O95260 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATE1O95260 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATE1O95260 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATE1O95260 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATE1O95260 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATE1O95260 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATE1O95260 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATE1O95260 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATE1O95260 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATE1O95260 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATE1O95260 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATE1O95260 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATE1O95260 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATE1O95260 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATE1O95260 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATE1O95260 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATE1O95260 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms