Protein–RNA interactions for Protein: O75581

LRP6, Low-density lipoprotein receptor-related protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP6O75581 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
LRP6O75581 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
LRP6O75581 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
LRP6O75581 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
LRP6O75581 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
LRP6O75581 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC33.64■■■□□ 2.98
LRP6O75581 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
LRP6O75581 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
LRP6O75581 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
LRP6O75581 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
LRP6O75581 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
LRP6O75581 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
LRP6O75581 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
LRP6O75581 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
LRP6O75581 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
LRP6O75581 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
LRP6O75581 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC33.6■■■□□ 2.97
LRP6O75581 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
LRP6O75581 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
LRP6O75581 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
LRP6O75581 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
LRP6O75581 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
LRP6O75581 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
LRP6O75581 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
LRP6O75581 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
LRP6O75581 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
LRP6O75581 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
LRP6O75581 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
LRP6O75581 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
LRP6O75581 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
LRP6O75581 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
LRP6O75581 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
LRP6O75581 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
LRP6O75581 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
LRP6O75581 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
LRP6O75581 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
LRP6O75581 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
LRP6O75581 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
LRP6O75581 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
LRP6O75581 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
LRP6O75581 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
LRP6O75581 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
LRP6O75581 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
LRP6O75581 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
LRP6O75581 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
LRP6O75581 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
LRP6O75581 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
LRP6O75581 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
LRP6O75581 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
LRP6O75581 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
LRP6O75581 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
LRP6O75581 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
LRP6O75581 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
LRP6O75581 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
LRP6O75581 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
LRP6O75581 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
LRP6O75581 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
LRP6O75581 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
LRP6O75581 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
LRP6O75581 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
LRP6O75581 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
LRP6O75581 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
LRP6O75581 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
LRP6O75581 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
LRP6O75581 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
LRP6O75581 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC33.45■■■□□ 2.94
LRP6O75581 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
LRP6O75581 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
LRP6O75581 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
LRP6O75581 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
LRP6O75581 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
LRP6O75581 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
LRP6O75581 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
LRP6O75581 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
LRP6O75581 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
LRP6O75581 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
LRP6O75581 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
LRP6O75581 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
LRP6O75581 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
LRP6O75581 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
LRP6O75581 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
LRP6O75581 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
LRP6O75581 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
LRP6O75581 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
LRP6O75581 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
LRP6O75581 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
LRP6O75581 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
LRP6O75581 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
LRP6O75581 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
LRP6O75581 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
LRP6O75581 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.93
LRP6O75581 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.93
LRP6O75581 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
LRP6O75581 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
LRP6O75581 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
LRP6O75581 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
LRP6O75581 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC33.36■■■□□ 2.93
LRP6O75581 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
LRP6O75581 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
LRP6O75581 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms